121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1633 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1633  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 178 aa  365  1e-100  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 178 aa  91.7  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 184 aa  89.4  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  28.74 
 
 		 210 aa  89  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 184 aa  87.8  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0247  transcriptional regulator, putative  27.54 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4896  AcrR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 184 aa  78.2  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0202  putative transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2575  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2629  regulatory protein TetR  30.77 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1274  transcriptional regulator  33.66 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.636376  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 190 aa  60.8  0.000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2135  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000090207  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2544  TetR family transcriptional regulator  22.68 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.68264  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 211 aa  57  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3279  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649622  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2345  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.328498  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2118  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000195115  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  22.22 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03160  transcriptional regulator  27.67 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0483  transcriptional regulator  25.57 
 
 		 172 aa  52.4  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000428437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 200 aa  52.4  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  39.13 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.852113 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 205 aa  52  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1897  TetR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0015  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  27.48 
 
 		 184 aa  49.7  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  38.57 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00610  transcriptional regulator  32.41 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  27.48 
 
 		 184 aa  48.9  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 195 aa  48.9  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2738  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 181 aa  48.5  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000104447  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 202 aa  48.1  0.00006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 184 aa  48.1  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1946  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 183 aa  47.8  0.00009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 201 aa  47.8  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  26.37 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0158  transcriptional regulator, TetR family  22.95 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 251 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04120  hypothetical protein  25.74 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.453544  normal  0.455959 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0887  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0943  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 219 aa  45.8  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  23.73 
 
 		 212 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1027  transcriptional regulator, TetR-related family  36.36 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34456e-23 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2537  putative transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0946  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 191 aa  45.4  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.611956  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  26.13 
 
 		 197 aa  45.4  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1114  transcriptional regulator, TetR-related family  36.36 
 
 		 191 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0987  transcriptional regulator, TetR-related family  36.36 
 
 		 191 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4326  transcriptional regulator, TetR-related family  36.36 
 
 		 191 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3195  regulatory protein  26.79 
 
 		 181 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 497 aa  45.1  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 224 aa  44.7  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  39.62 
 
 		 177 aa  44.7  0.0007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 201 aa  44.3  0.0009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2963  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  23.21 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0844  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 208 aa  43.9  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06360  transcriptional regulator  23.33 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.589658  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 194 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0215  transcriptional regulator  36.11 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.532306  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0887  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0079  transcriptional regulator, TetR family  23.65 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0990564  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2378  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.576204  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2424  regulatory protein TetR  36.54 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.428884  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  21.97 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11210  transcriptional regulator, tetR family  36.21 
 
 		 203 aa  43.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 181 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24160  hypothetical protein  24.78 
 
 		 194 aa  42.4  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  22.7 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 198 aa  42  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1193  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 210 aa  42  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000366279  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03060  transcriptional regulator, tetR family  33.33 
 
 		 201 aa  42  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>