139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_03160 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_03160  transcriptional regulator  100 
 
 		 175 aa  364  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 205 aa  62  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11210  transcriptional regulator, tetR family  26.44 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0906  hypothetical protein  24.72 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0964  hypothetical protein  24.72 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2667  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000225339  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00610  transcriptional regulator  24.71 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1133  hypothetical protein  24.16 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1053  hypothetical protein  24.16 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00146188  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3299  regulatory protein, TetR  42.37 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 211 aa  57.8  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1007  hypothetical protein  24.86 
 
 		 188 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.374839  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0610  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 189 aa  57.4  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.442155  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1514  AcrR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 189 aa  57  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  23.35 
 
 		 205 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  30.43 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0888  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.845655  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0869  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  24.12 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  22.75 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0874  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  22.75 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4295  hypothetical protein  23.6 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1648  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00269444  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0364  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.233701  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1633  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4896  AcrR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 184 aa  52  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 178 aa  52  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 184 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1946  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 183 aa  50.8  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0361  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21730  transcriptional regulator  24.56 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000276333  normal  0.440212 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 195 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  20.12 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1970  TetR/AcrR family transcriptional regulator  22.81 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000170577  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2135  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 179 aa  49.3  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000090207  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0483  transcriptional regulator  22.54 
 
 		 172 aa  48.9  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000428437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  42 
 
 		 185 aa  48.1  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.852113 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0813  transcriptional regulator  25.83 
 
 		 181 aa  47.8  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000037914  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  24.4 
 
 		 205 aa  47.8  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 208 aa  47  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  23.35 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1572  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6259  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 205 aa  47  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6735  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0323  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 227 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.939407  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4584  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4579  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 230 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1310  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 182 aa  46.2  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000104064  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4837  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 237 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4925  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 237 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.733021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1048  probable dihydroxyacetone kinase regulator  24.14 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.65862e-21 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2392  transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 184 aa  45.4  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.255301 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 224 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1173  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 218 aa  45.4  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0461  TetR family transcriptional regulator  20.93 
 
 		 219 aa  45.4  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 181 aa  45.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09210  transcriptional regulator, tetR family  36.92 
 
 		 217 aa  45.4  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.355198  normal  0.265854 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 205 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1809  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 211 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1856  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 211 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 224 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1790  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 211 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.305772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2378  TetR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 184 aa  45.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.576204  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2424  regulatory protein TetR  22.86 
 
 		 184 aa  45.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.428884  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 224 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 224 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 204 aa  44.7  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 201 aa  44.7  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  33.33 
 
 		 204 aa  44.3  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5390  transcriptional regulator, TetR family  25.16 
 
 		 291 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.787919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0324  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  24.28 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0197  hypothetical protein  39.62 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000319067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1478  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 186 aa  44.3  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1164  putative transcriptional regulator, TetR family  21.82 
 
 		 198 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.296782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3279  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649622  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  32.05 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 224 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1709  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2615  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2669  hypothetical protein  35.85 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 207 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0176  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1364  TetR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5887  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825874 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>