79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_11210 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_11210  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 203 aa  429  1e-119  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2537  putative transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 203 aa  97.4  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26420  hypothetical protein  28.4 
 
 		 187 aa  95.9  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0969  putative transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.043647  hitchhiker  0.0000349278 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0610  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.442155  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1164  putative transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.296782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1714  hypothetical protein  28.1 
 
 		 152 aa  63.2  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1710  hypothetical protein  26.34 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04190  transcriptional regulator, tetR family  29.59 
 
 		 184 aa  62  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.584897 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2667  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000225339  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03160  transcriptional regulator  26.44 
 
 		 175 aa  61.2  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00610  transcriptional regulator  23.28 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0254  hypothetical protein  26.7 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 181 aa  56.6  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3106  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2824  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.551621  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2131  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3118  transcriptional regulator, TetR family  24.61 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1946  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 183 aa  52.4  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2898  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3115  TetR family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4177  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 181 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1164  hypothetical protein  36.56 
 
 		 181 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24520  transcriptional regulator, tetR family  23.12 
 
 		 184 aa  51.2  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3139  transcriptional regulator, TetR family  24.08 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.145779  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3136  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.495546  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0247  transcriptional regulator, putative  40 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0738  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0636696  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3249  transcriptional regulator, putative  39.06 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00603591  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1009  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.874383  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04470  transcriptional regulator, tetR family  44.9 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000324783 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  24.29 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3662  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 178 aa  49.3  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  27.17 
 
 		 177 aa  48.9  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1263  hypothetical protein  34.41 
 
 		 181 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1210  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 181 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4896  AcrR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 184 aa  48.1  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1792  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1648  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 178 aa  46.6  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00269444  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  47.5 
 
 		 219 aa  46.6  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04420  transcriptional regulator, tetR family  38.78 
 
 		 187 aa  46.2  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197564 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25960  transcriptional regulator, tetR family  39.62 
 
 		 185 aa  45.8  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.852113 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2629  regulatory protein TetR  40 
 
 		 182 aa  45.4  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2575  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 182 aa  45.4  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4295  hypothetical protein  21.93 
 
 		 188 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2357  transcriptional regulator, TetR family  22.73 
 
 		 190 aa  45.1  0.0007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0067585  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22230  transcriptional regulator  20.81 
 
 		 187 aa  45.1  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.158788 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4877  transcriptional regulator, TetR family  44.19 
 
 		 201 aa  45.1  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.268958  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3307  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 180 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0386151  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1053  hypothetical protein  36.36 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00146188  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  43.18 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0964  hypothetical protein  37.74 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0874  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0869  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1133  hypothetical protein  37.74 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0906  hypothetical protein  37.74 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  43.18 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1007  hypothetical protein  37.74 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.374839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  43.18 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0888  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.845655  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00940  transcriptional regulator  38.89 
 
 		 180 aa  43.1  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.146478  normal  0.42367 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1633  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 178 aa  43.1  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000605671  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0403  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 195 aa  42.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1274  transcriptional regulator  38.18 
 
 		 191 aa  42.7  0.004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.636376  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 206 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2378  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 184 aa  42.4  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.576204  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2424  regulatory protein TetR  41.3 
 
 		 184 aa  42.4  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.428884  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2558  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 175 aa  42  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>