84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2558 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2558  transcriptional regulator  100 
 
 		 175 aa  357  4e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3307  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0386151  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1608  transcriptional regulator  27.63 
 
 		 176 aa  62  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0667725  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1310  TetR family transcriptional regulator  21.47 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000104064  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2459  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 198 aa  48.9  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.285748  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1970  TetR/AcrR family transcriptional regulator  23.98 
 
 		 179 aa  48.5  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000170577  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4182  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 201 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.368627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 216 aa  47  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2807  regulatory protein TetR  32.84 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00102447  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  31.96 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  24.34 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0079  transcriptional regulator, TetR family  26.43 
 
 		 188 aa  46.2  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0990564  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2496  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 198 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1769  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 198 aa  45.8  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 202 aa  45.4  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3384  TetR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 193 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3373  TetR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 193 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.946701  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2135  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 179 aa  45.1  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000090207  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 203 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3435  TetR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 193 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0970833  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 200 aa  44.7  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0483  transcriptional regulator  32.2 
 
 		 172 aa  45.1  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000428437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3941  transcriptional regulator, TetR family  21.76 
 
 		 222 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5559  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 289 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 191 aa  44.3  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5390  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 291 aa  44.3  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.787919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4608  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.198377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0421  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 219 aa  43.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  29.69 
 
 		 232 aa  43.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1797  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 197 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  42.5 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0303  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00708396  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0450  transcriptional regulator, TetR family  24.5 
 
 		 213 aa  42.7  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.258482 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1677  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 257 aa  43.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.981661 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3299  regulatory protein, TetR  29.82 
 
 		 216 aa  43.1  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1288  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 211 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2773  TetR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.704113  normal  0.8573 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0758  transcriptional regulator  21.48 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000100978  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0628  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 262 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0323336 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 193 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4031  DNA-binding transcriptional repressor FabR  35.59 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 227 aa  42.7  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 222 aa  42.4  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 200 aa  42.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 203 aa  42.4  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 200 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 225 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5228  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 290 aa  42.4  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  20.96 
 
 		 212 aa  42.4  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4096  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428343  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0228  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 201 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.527328  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1946  TetR family transcriptional regulator  20 
 
 		 183 aa  42  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 215 aa  42.4  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11210  transcriptional regulator, tetR family  31.58 
 
 		 203 aa  42  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 150 aa  41.6  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335686 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 197 aa  41.6  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 218 aa  42  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 183 aa  41.6  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  45.24 
 
 		 195 aa  41.6  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 200 aa  41.6  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3195  regulatory protein  22.09 
 
 		 181 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  27.63 
 
 		 205 aa  41.2  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03580  DNA-binding transcriptional repressor FabR  35.59 
 
 		 197 aa  41.2  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.163329  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0215  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 191 aa  41.2  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.532306  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5615  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 291 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2581  regulatory protein, TetR  28 
 
 		 197 aa  40.8  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5113  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 290 aa  40.8  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5288  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 290 aa  40.8  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5567  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 290 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5685  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 290 aa  40.8  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 197 aa  40.8  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5529  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 290 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0331  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 209 aa  40.8  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1489  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 212 aa  40.8  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24500  transcriptional regulator  23.57 
 
 		 202 aa  40.8  0.01  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>