89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3307 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3307  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 180 aa  356  8e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0386151  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2558  transcriptional regulator  38.82 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0483  transcriptional regulator  19.63 
 
 		 172 aa  57.8  0.00000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000428437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0287  hypothetical protein  27.5 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.356291  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0969  putative transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 214 aa  52.4  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.043647  hitchhiker  0.0000349278 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0758  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 193 aa  51.2  0.000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000100978  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 197 aa  51.2  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3299  regulatory protein, TetR  26.51 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1310  TetR family transcriptional regulator  18.13 
 
 		 182 aa  49.3  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000104064  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 310 aa  48.9  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  20.39 
 
 		 217 aa  48.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1059  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1608  transcriptional regulator  22.22 
 
 		 176 aa  45.8  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0667725  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  29.37 
 
 		 205 aa  45.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1007  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.587433  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  21.88 
 
 		 205 aa  45.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04420  transcriptional regulator, tetR family  20.24 
 
 		 187 aa  44.7  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197564 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1164  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 198 aa  44.7  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.296782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11210  transcriptional regulator, tetR family  36.54 
 
 		 203 aa  44.7  0.0007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 271 aa  44.7  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  21.43 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0887  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00610  transcriptional regulator  28.44 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.309946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1027  transcriptional regulator, TetR-related family  29.89 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34456e-23 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 205 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0943  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1626  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432632 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2816  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1547  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0308789 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1257  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 224 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2963  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  21.11 
 
 		 226 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04470  transcriptional regulator, tetR family  22.67 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000324783 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1283  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 224 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20735  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1274  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 224 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.941811 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3666  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 194 aa  42.4  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1584  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  42.4  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4773  regulatory protein TetR  35.29 
 
 		 184 aa  42  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550217  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  21.05 
 
 		 214 aa  42.4  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  22.73 
 
 		 204 aa  42  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 193 aa  42.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03880  transcriptional regulator TetR family  22.02 
 
 		 226 aa  42  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.568548  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  24.66 
 
 		 208 aa  41.6  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1769  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 198 aa  42  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6735  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 200 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1572  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 200 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3279  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 192 aa  42  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.649622  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 198 aa  42  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 216 aa  42  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6259  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 200 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3577  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 218 aa  42  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4816  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 244 aa  42  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0244477 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 184 aa  41.6  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5663  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 214 aa  41.2  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0257  transcriptional regulator, TetR family  18.18 
 
 		 183 aa  41.6  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.115958 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3333  transcriptional regulator, TetR family  23.03 
 
 		 202 aa  41.2  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.202273 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0744  hypothetical protein  31.91 
 
 		 184 aa  41.2  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.202203  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0727  hypothetical protein  31.91 
 
 		 184 aa  41.2  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2667  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 185 aa  41.2  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000225339  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0836  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 181 aa  41.6  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1677  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 257 aa  41.2  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.981661 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 200 aa  41.2  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0888  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 188 aa  41.2  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.845655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0869  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 188 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0610  TetR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 189 aa  41.2  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.442155  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0874  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 188 aa  41.2  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 291 aa  41.2  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1133  hypothetical protein  28.74 
 
 		 188 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 206 aa  40.8  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4326  transcriptional regulator, TetR-related family  29.89 
 
 		 191 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 213 aa  40.8  0.009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0628  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 262 aa  41.2  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0323336 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 206 aa  40.8  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1114  transcriptional regulator, TetR-related family  29.89 
 
 		 191 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 206 aa  40.8  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2287  transcriptional regulator, TetR family  18.18 
 
 		 218 aa  41.2  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.101004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2347  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 194 aa  41.2  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal  0.0620265 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  25.86 
 
 		 202 aa  40.8  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3734  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 216 aa  40.8  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3807  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 216 aa  40.8  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.225103  normal  0.0640685 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0964  hypothetical protein  28.74 
 
 		 188 aa  40.8  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0665  transcriptional regulator, TetR family  22.97 
 
 		 195 aa  40.8  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11957  normal  0.196161 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3746  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 216 aa  40.8  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.29443  normal  0.952036 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4295  hypothetical protein  28.74 
 
 		 188 aa  40.8  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0906  hypothetical protein  28.74 
 
 		 188 aa  40.8  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>