More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4773 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_4773  regulatory protein TetR  100 
 
 		 184 aa  365  1e-100  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550217  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 199 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4573  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4661  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4956  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 197 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0932682 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 207 aa  51.2  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 224 aa  51.2  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1241  regulatory protein TetR  34.62 
 
 		 193 aa  50.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0907421  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  39.62 
 
 		 226 aa  49.7  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3496  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 220 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 268 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  25.3 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1206  regulatory protein TetR  34.29 
 
 		 194 aa  49.3  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  24.27 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 234 aa  48.9  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 206 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 203 aa  48.9  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0123  regulatory protein, TetR  43.64 
 
 		 187 aa  48.5  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156619  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1353  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 217 aa  48.1  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3166  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 234 aa  48.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.335744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 203 aa  48.1  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 188 aa  48.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0039  transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1335  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 235 aa  47.8  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13278  TetR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 211 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.627174 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 230 aa  47.8  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3035  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 225 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 188 aa  47  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5054  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.817621 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1371  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 274 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1018  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5385  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0901691 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1794  transcriptional regulator  39.62 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  38.98 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2410  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 243 aa  46.2  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3257  transcriptional regulator, TetR family protein  30.69 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.696599 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  36.36 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4096  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 201 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428343  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 214 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 196 aa  45.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3290  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 225 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413178  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  26.59 
 
 		 185 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2746  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4281  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 208 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130087  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 205 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02851  putative transcriptional repressor for the cellular response to osmotic stress (TetR/AcrR family) protein  31.03 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 214 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  45.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 235 aa  45.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  21.21 
 
 		 193 aa  45.4  0.0004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2365  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 213 aa  45.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227272  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5737  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 203 aa  45.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 191 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 237 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 199 aa  45.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 191 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  23.26 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3625  regulatory protein TetR  25 
 
 		 191 aa  45.4  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0478  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 321 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1484  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 205 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 201 aa  45.4  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2450  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 213 aa  45.1  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 202 aa  45.1  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  27.2 
 
 		 212 aa  45.1  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 206 aa  45.1  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 189 aa  45.1  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1745  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 243 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 191 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  24.72 
 
 		 211 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 203 aa  44.7  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 204 aa  44.7  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0347  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 213 aa  44.7  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421077  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 214 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>