80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3496 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3496  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 220 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3011  TetR family transcriptional regulator  82.59 
 
 		 214 aa  304  6e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0859343 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3626  TetR family transcriptional regulator  67.5 
 
 		 202 aa  259  2e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.757995 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3558  TetR family transcriptional regulator  67.5 
 
 		 202 aa  259  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.267611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3553  TetR family transcriptional regulator  67.5 
 
 		 202 aa  259  2e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.500909  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1508  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 205 aa  178  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1486  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 205 aa  178  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1484  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 205 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4281  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130087  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0372  TetR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 211 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462449 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2465  transcriptional regulator, TetR family  55.96 
 
 		 202 aa  171  7.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4956  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 197 aa  166  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0932682 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4661  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 197 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4573  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 197 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0364  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113387 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5152  TetR family transcriptional regulator  45.64 
 
 		 206 aa  152  5e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1606  TetR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 203 aa  150  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.752317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4911  TetR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 206 aa  146  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3973  regulatory protein TetR  42.64 
 
 		 204 aa  145  6e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4096  TetR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 201 aa  102  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428343  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4113  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 204 aa  95.9  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185648  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2232  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.347192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 197 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  27.97 
 
 		 200 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4083  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 214 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.843798  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  33.68 
 
 		 192 aa  48.5  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  36.19 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3399  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 206 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0861975  normal  0.425291 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1745  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6467  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  32.23 
 
 		 229 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3306  regulatory protein TetR  46.81 
 
 		 189 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000516611  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4718  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2444  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2817  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2461  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 196 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000138739  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 194 aa  43.5  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 385 aa  42.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3108  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 185 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3324  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 185 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3313  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 185 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.212765  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3094  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 185 aa  42.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.432559  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3354  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 185 aa  42.7  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 206 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1833  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 206 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3326  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 185 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  21.76 
 
 		 310 aa  42.4  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 236 aa  42.4  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 208 aa  42  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 209 aa  42.4  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4909  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 237 aa  42  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1477  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 238 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 255 aa  42  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 213 aa  42  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 216 aa  42  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1502  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 235 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 216 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 216 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1480  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 235 aa  42  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  42  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0628  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 262 aa  41.6  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0323336 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 210 aa  41.6  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7959  putative transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 194 aa  41.6  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
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