110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1745 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



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Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1745  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
243 aa  495  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4718  TetR family transcriptional regulator  84.75 
 
 
260 aa  393  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1335  TetR family transcriptional regulator  75.8 
 
 
235 aa  340  9e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1371  TetR family transcriptional regulator  76.39 
 
 
274 aa  339  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1353  TetR family transcriptional regulator  80.4 
 
 
217 aa  333  2e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13278  TetR family transcriptional regulator  75.76 
 
 
211 aa  318  3.9999999999999996e-86  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.627174 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2746  transcriptional regulator, TetR family  38.17 
 
 
201 aa  138  6e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5737  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 
203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2461  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 
196 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000138739  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0561  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 
197 aa  99.8  3e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3220  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
206 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3282  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
206 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688565  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3231  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 
206 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.140653  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3788  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 
194 aa  72.8  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.263954  normal  0.238282 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0478  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 
321 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1484  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 
205 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 
228 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 
228 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 
228 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1486  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 
205 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1508  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 
205 aa  55.5  0.0000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 
193 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 
193 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 
193 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 
197 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1398  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 
193 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.211037  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0123  regulatory protein, TetR  27.22 
 
 
187 aa  52.8  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156619  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 
197 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  27.51 
 
 
202 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1156  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 
227 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 
200 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
188 aa  48.9  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4281  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 
208 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130087  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  46.34 
 
 
223 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0372  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
211 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.462449 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25250  transcriptional regulator  28.42 
 
 
190 aa  48.1  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.862967  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4086  putative transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
203 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
222 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7183  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
219 aa  47  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00902217 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3496  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 
220 aa  47  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  28.34 
 
 
192 aa  46.6  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 
193 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 
231 aa  45.4  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  25.18 
 
 
400 aa  45.4  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0566  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 
207 aa  45.4  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 
214 aa  45.4  0.0008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 
235 aa  45.4  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4773  regulatory protein TetR  43.48 
 
 
184 aa  45.4  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550217  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
205 aa  45.4  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0364  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
220 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.113387 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3011  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 
214 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0859343 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1681  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 
216 aa  44.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.977422 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 
205 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 
218 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 
219 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 
186 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 
222 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1382  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 
241 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0100297  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4590  regulatory protein TetR  28.57 
 
 
206 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5365  transcriptional regulator, TetR family  29.36 
 
 
176 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5414  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 
192 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
289 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5058  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
221 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5146  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
209 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5437  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 
209 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195882  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  24.22 
 
 
203 aa  43.5  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1453  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 
183 aa  43.5  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 
211 aa  43.1  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  21.37 
 
 
206 aa  43.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2323  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
206 aa  43.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.169023  normal  0.0173664 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 
191 aa  43.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
226 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1648  TetR family transcriptional regulator  21.84 
 
 
178 aa  42.7  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00269444  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  25.53 
 
 
222 aa  42.7  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  30.56 
 
 
204 aa  42.7  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
222 aa  42.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 
215 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 
215 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 
215 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
210 aa  42.7  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 
200 aa  42.7  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 
203 aa  42.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2181  regulatory protein TetR  32 
 
 
191 aa  42.7  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.852456  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 
205 aa  42.7  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  22.06 
 
 
177 aa  42.7  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 
191 aa  42.7  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 
210 aa  42.7  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 
221 aa  42.4  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_126  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
216 aa  42.7  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 
233 aa  42.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
234 aa  42.4  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  26.58 
 
 
200 aa  42.4  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  22.82 
 
 
200 aa  42.4  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1536  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
217 aa  42  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000773904  normal  0.689031 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  39.13 
 
 
230 aa  42.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 
211 aa  42  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_014230  CA2559_01975  hypothetical protein  28.38 
 
 
204 aa  42  0.009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.10817  n/a   
 
 
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