194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5365 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5365  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 176 aa  338  2e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0654  transcriptional regulator, TetR family  45.66 
 
 		 185 aa  103  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 200 aa  52  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 221 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 221 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 221 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 215 aa  51.6  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 197 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1256  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259056 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 215 aa  48.9  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 201 aa  48.9  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 217 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 197 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 197 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 188 aa  48.5  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0121  regulatory protein, TetR  31.97 
 
 		 209 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.602969 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 200 aa  48.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  43.86 
 
 		 226 aa  47.8  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 192 aa  47.4  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  41.43 
 
 		 196 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 218 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 198 aa  47  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  31.37 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1007  transcriptional regulator, TetR family  23.29 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.587433  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 330 aa  46.6  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 220 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2689  TetR family transcriptional regulator  20.41 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2746  regulatory protein TetR  20.41 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 196 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 204 aa  46.2  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 197 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2910  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 215 aa  45.8  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 224 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 224 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1745  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 243 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 224 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 224 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 198 aa  45.8  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 205 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 221 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 211 aa  45.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3067  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 199 aa  45.4  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 213 aa  45.4  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 223 aa  45.4  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 190 aa  45.4  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 202 aa  45.1  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3293  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 200 aa  45.1  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000151669  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 200 aa  45.4  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 221 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 200 aa  45.1  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 254 aa  45.1  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 257 aa  44.7  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 214 aa  44.7  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 206 aa  44.3  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 218 aa  44.3  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 223 aa  44.3  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  30.47 
 
 		 218 aa  44.3  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 199 aa  44.3  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  36.23 
 
 		 197 aa  44.3  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 201 aa  44.3  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1059  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0115  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0203  regulatory protein TetR  40 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.041689  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4802  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 215 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.96494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 317 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 216 aa  43.9  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3666  TetR family transcriptional regulator  21.92 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3253  transcriptional regulator  21.92 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0516477  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 202 aa  43.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5734  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.801726 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 241 aa  43.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0044  nucleoid occlusion protein  24.82 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00442405  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 190 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 228 aa  43.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 218 aa  43.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2693  regulatory protein TetR  51.28 
 
 		 192 aa  42.4  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0770653  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3117  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>