130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0372 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0372  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  425  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462449 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0364  TetR family transcriptional regulator  73.56 
 
 		 220 aa  313  9.999999999999999e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113387 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4281  TetR family transcriptional regulator  69 
 
 		 208 aa  286  1e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130087  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1486  TetR family transcriptional regulator  66.17 
 
 		 205 aa  280  1e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1508  TetR family transcriptional regulator  66.17 
 
 		 205 aa  280  1e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1484  TetR family transcriptional regulator  65.67 
 
 		 205 aa  279  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4956  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 197 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0932682 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4573  TetR family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 197 aa  197  7e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4661  TetR family transcriptional regulator  51.28 
 
 		 197 aa  197  7e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5152  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 206 aa  175  5e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1606  TetR family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 203 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.752317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3496  TetR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3973  regulatory protein TetR  44.39 
 
 		 204 aa  169  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3553  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 202 aa  165  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.500909  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3626  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 202 aa  165  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.757995 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3558  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 202 aa  165  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.267611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4911  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 206 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3011  TetR family transcriptional regulator  44.1 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0859343 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2465  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4096  TetR family transcriptional regulator  38.58 
 
 		 201 aa  124  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428343  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4113  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 204 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185648  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2232  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.347192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  32.76 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 236 aa  62  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4083  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.843798  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0561  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 197 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2461  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000138739  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3399  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0861975  normal  0.425291 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 204 aa  51.6  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4590  regulatory protein TetR  35.42 
 
 		 206 aa  51.6  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0566  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 193 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 193 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 193 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 193 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3793  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 205 aa  48.5  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1745  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 243 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  24.86 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0045  transcriptional regulator  35 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0375278  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4718  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 260 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0703  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 216 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 385 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2019  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 235 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 211 aa  45.1  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 223 aa  45.1  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 194 aa  45.1  0.0008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 188 aa  45.1  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  48.94 
 
 		 209 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04693  transcriptional regulator TetR/acrR family  32.94 
 
 		 232 aa  45.1  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 219 aa  45.1  0.0009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 224 aa  45.1  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1454  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 231 aa  45.1  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1353  TetR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0354  hypothetical protein  27.66 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0313675 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1292  regulatory protein TetR  38.18 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  24.03 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1335  TetR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4249  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.399807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1371  TetR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 274 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3271  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377871  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2306  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3562  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 237 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0478  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 321 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2346  hypothetical protein  27.66 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5768  putative transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 239 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0636  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 250 aa  43.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0304513 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 218 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13278  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.627174 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3866  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 230 aa  43.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599707  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  32.95 
 
 		 280 aa  42.7  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3220  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3282  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 176 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3231  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.140653  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>