More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1382 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1382  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 241 aa  460  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0100297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3010  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 218 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2572  regulatory protein TetR  38.43 
 
 		 238 aa  123  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5760  putative transcriptional regulator, TetR family  38.97 
 
 		 209 aa  115  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238463  normal  0.204819 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3693  regulatory protein TetR  34.91 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.000370458  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2689  putative transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 325 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.559134 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 220 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2095  TetR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 222 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.112478 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0691  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 218 aa  93.6  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.545949 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3745  hypothetical protein  35.58 
 
 		 240 aa  88.6  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.239031  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8662  transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4341  putative transcriptional regulator, TetR family  33.97 
 
 		 210 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.13823  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9036  putative transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 214 aa  86.3  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.505167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2744  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46518  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2788  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 214 aa  82  0.000000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2774  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.783627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1039  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.230072 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1169  regulatory protein, TetR  31.19 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1030  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 220 aa  77  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.642765  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1997  TetR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0474929  normal  0.0514197 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5762  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.182054  normal  0.0696367 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2613  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.443179 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3160  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4233  transcriptional regulator, TetR family  51.52 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0221768  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3795  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277058  hitchhiker  0.000257317 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3471  transcriptional regulator, TetR family  52.27 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6309  putative transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 197 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407991  normal  0.0813971 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3759  transcriptional regulator, TetR family  52.27 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  29.22 
 
 		 226 aa  53.1  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0296  transcriptional regulator, TetR family  26.82 
 
 		 216 aa  53.1  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1477  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 196 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1859  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 196 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1799  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 196 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1658  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 196 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.166061 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 200 aa  52.4  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 211 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 211 aa  52.4  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 211 aa  52.4  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 211 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 208 aa  52.4  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 211 aa  52.4  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 211 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1797  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 196 aa  52  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.125509  normal  0.0456013 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5615  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328639  normal  0.169387 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 193 aa  51.6  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  52.94 
 
 		 223 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 191 aa  51.6  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 190 aa  50.8  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13278  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 211 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.627174 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  44 
 
 		 205 aa  50.4  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  46.27 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 195 aa  49.7  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  42.86 
 
 		 216 aa  50.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 243 aa  49.7  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4551  regulatory protein TetR  29.72 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3772  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 201 aa  50.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  38.46 
 
 		 195 aa  49.7  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 211 aa  49.7  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 194 aa  49.3  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 226 aa  49.7  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2595  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 218 aa  49.3  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000390458  hitchhiker  0.00180541 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 207 aa  48.9  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 209 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 197 aa  48.9  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 213 aa  48.9  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0743  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 230 aa  48.9  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.803231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5175  putative transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 205 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0125916  hitchhiker  0.00846982 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1353  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 217 aa  48.9  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 217 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 213 aa  48.5  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 211 aa  48.5  0.00009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  37.7 
 
 		 211 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  37.7 
 
 		 211 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  37.7 
 
 		 211 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4148  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8904  putative transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 497 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5867  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 193 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0832592  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 234 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 229 aa  48.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 200 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5146  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  37.7 
 
 		 211 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  37.7 
 
 		 211 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>