59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2323 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2323  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  407  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.169023  normal  0.0173664 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6398  TetR family transcriptional regulator  56.72 
 
 		 216 aa  216  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237377  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3925  TetR family transcriptional regulator  49.75 
 
 		 213 aa  169  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.376299  normal  0.034998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1788  regulatory protein TetR  50.79 
 
 		 219 aa  160  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3058  transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000151008  decreased coverage  0.0000000705144 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3660  resolvase domain-containing protein  31.68 
 
 		 203 aa  62  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0726  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.892311  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  33.58 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 237 aa  48.9  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0992  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4614  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 222 aa  45.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 188 aa  45.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 199 aa  45.1  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 207 aa  45.1  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 280 aa  44.7  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0270  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21920  transcriptional regulator  59.38 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.048177  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 283 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  40.35 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 231 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 332 aa  43.1  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  32.91 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1745  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 243 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 234 aa  42.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 202 aa  42.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 209 aa  42.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 183 aa  42.7  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 204 aa  42.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 216 aa  42  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13530  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 186 aa  42  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00114254  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 236 aa  42  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  40.32 
 
 		 182 aa  42  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1159  regulatory protein, TetR  37.5 
 
 		 231 aa  41.6  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 184 aa  41.6  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3010  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 218 aa  41.6  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 215 aa  41.6  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1035  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 227 aa  41.6  0.008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168916  normal  0.097412 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 191 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 199 aa  41.6  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 191 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 212 aa  41.6  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 191 aa  41.6  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 199 aa  41.2  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 181 aa  41.2  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 193 aa  41.2  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1310  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 182 aa  41.2  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000104064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>