173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1035 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1035  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 227 aa  466  1.0000000000000001e-131  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168916  normal  0.097412 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1159  regulatory protein, TetR  89.78 
 
 		 231 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0005  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0576727  normal  0.763846 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1288  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 211 aa  87  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2397  regulatory protein, TetR  26.94 
 
 		 225 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  23.77 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4314  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.316546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2032  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44645  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  36.54 
 
 		 225 aa  52  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 205 aa  52  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 198 aa  52  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3613  regulatory protein, TetR  38.1 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  40.58 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 215 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3914  putative transcriptional regulator  46.43 
 
 		 234 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.201642  normal  0.600336 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1809  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300582  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1856  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1790  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.305772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  35.06 
 
 		 200 aa  49.3  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4128  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 218 aa  48.9  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 218 aa  48.9  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  30.47 
 
 		 200 aa  48.5  0.00008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 222 aa  48.5  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 		 218 aa  48.5  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  48.94 
 
 		 280 aa  48.5  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6881  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0734971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  33.85 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  35.59 
 
 		 390 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3816  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6770  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1551  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6278  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.185779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 		 205 aa  46.2  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 253 aa  46.2  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 209 aa  45.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 214 aa  45.8  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3432  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0339823  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3534  hypothetical protein  40 
 
 		 239 aa  45.8  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 203 aa  45.8  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0540  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 247 aa  45.4  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000321251  hitchhiker  0.0000104132 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 212 aa  45.4  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 209 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 209 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 192 aa  45.4  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 250 aa  45.4  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 195 aa  45.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4757  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 247 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 222 aa  45.1  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 221 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  23.21 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0758  transcriptional regulator  24.62 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000100978  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4995  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 198 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1837  transcriptional regulator EefR  29.17 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000033131 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 259 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1262  hypothetical protein  24.66 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.683399  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  32.39 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0005  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0931339  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 208 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 218 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  34.85 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4331  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 257 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3541  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 200 aa  43.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  32.53 
 
 		 264 aa  43.5  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 236 aa  43.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 214 aa  43.5  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 225 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3103  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 207 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  37.68 
 
 		 226 aa  43.5  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 211 aa  43.5  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4822  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3795  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 202 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277058  hitchhiker  0.000257317 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>