284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3103 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_3103  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  418  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3432  TetR family transcriptional regulator  78.43 
 
 		 211 aa  333  1e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0339823  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1734  TetR family transcriptional regulator  53.5 
 
 		 210 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657322  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1753  TetR family transcriptional regulator  53.5 
 
 		 210 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1800  TetR family transcriptional regulator  53.5 
 
 		 210 aa  212  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.865555  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2546  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.275318  decreased coverage  0.00000294801 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13891  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2767  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.430405  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5684  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000982546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2489  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.371609  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4314  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.316546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  26.43 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2809  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167328  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2568  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2754  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.864254  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0963  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553529  normal  0.247244 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2525  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  hitchhiker  0.00170542 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2762  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000444516 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2524  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 203 aa  62  0.000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000581245  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2788  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000644753  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1790  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.305772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1809  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300582  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2560  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.282393  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1856  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2032  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44645  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 255 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3182  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.86361 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  22.46 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  22.46 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0961  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  22.46 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4627  regulatory protein TetR  26.83 
 
 		 207 aa  52  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  21.74 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 191 aa  51.6  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5146  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 209 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 192 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5079  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 190 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1674  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5058  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3795  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277058  hitchhiker  0.000257317 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 191 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  35.19 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2389  nucleoid occlusion protein  37.93 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.102395  normal  0.522775 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 241 aa  49.3  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4193  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 302 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0423044  normal  0.257514 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 199 aa  48.9  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13075  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 226 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.576817 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3129  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.534094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23110  transcriptional regulator  38.33 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 297 aa  48.5  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4689  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 243 aa  48.1  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5437  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 209 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3882  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 210 aa  48.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  22.78 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1372  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3363  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0995  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6146  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  31.09 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.188874 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2370  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00377718  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3865  transcriptional regulator, TetR family protein  21.7 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  30.84 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  24.21 
 
 		 231 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  47.83 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 227 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_003296  RS01891  transcription regulator protein  36.78 
 
 		 219 aa  46.2  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139537  normal  0.638618 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 223 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  37.5 
 
 		 219 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 204 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1334  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05640  transcriptional regulator  41.38 
 
 		 223 aa  45.8  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.950785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 225 aa  45.4  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  24.7 
 
 		 201 aa  45.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  45.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  27.59 
 
 		 234 aa  45.8  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3921  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>