52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3534 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3534  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3914  putative transcriptional regulator  36.76 
 
 		 234 aa  115  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.201642  normal  0.600336 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3613  regulatory protein, TetR  33.18 
 
 		 243 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4541  regulatory protein, TetR  37.93 
 
 		 219 aa  105  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0842313  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3518  regulatory protein, TetR  32.54 
 
 		 215 aa  92.8  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640434  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0540  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 247 aa  81.3  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000321251  hitchhiker  0.0000104132 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0544  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000992558 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1288  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1159  regulatory protein, TetR  27.93 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1035  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168916  normal  0.097412 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 211 aa  52.4  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0005  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0576727  normal  0.763846 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 175 aa  49.7  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1567  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 261 aa  48.9  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.865657 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  26.13 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000380117  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 248 aa  46.6  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4314  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.316546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 250 aa  45.4  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 192 aa  45.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2032  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 213 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.44645  normal  0.684987 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4816  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0244477 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1626  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432632 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 209 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1856  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337362 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1730  regulatory protein, TetR  25.14 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25680  transcriptional regulator  36.54 
 
 		 203 aa  44.3  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1790  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.305772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1809  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 211 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300582  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2397  regulatory protein, TetR  37.93 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4031  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 203 aa  43.5  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 208 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 224 aa  42.7  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0813  AcrR/TetR family transcription regulator  40 
 
 		 227 aa  43.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 209 aa  43.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 254 aa  43.1  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2251  putative transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 187 aa  42.7  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  25.19 
 
 		 202 aa  42.7  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 210 aa  42.7  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 213 aa  42.4  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 225 aa  42.4  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0591  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 226 aa  42.4  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  36.25 
 
 		 326 aa  42.4  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 233 aa  42  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 226 aa  42  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2057  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 212 aa  42  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 204 aa  42  0.009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4799  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  41.6  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5341  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  41.6  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601109  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>