30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0544 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0544  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  450  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000992558 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0540  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 247 aa  160  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000321251  hitchhiker  0.0000104132 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3613  regulatory protein, TetR  32.06 
 
 		 243 aa  88.6  8e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3914  putative transcriptional regulator  29.95 
 
 		 234 aa  87.4  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.201642  normal  0.600336 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1567  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.865657 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0451  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00762729  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3518  regulatory protein, TetR  25.94 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.640434  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4541  regulatory protein, TetR  25.57 
 
 		 219 aa  52.4  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0842313  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3534  hypothetical protein  29.85 
 
 		 239 aa  48.9  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2397  regulatory protein, TetR  36 
 
 		 225 aa  48.5  0.00007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 259 aa  45.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 259 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 259 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1288  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5230  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 228 aa  42.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 257 aa  43.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2689  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 230 aa  42  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1323  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 207 aa  42  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 202 aa  42  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1493  DNA-binding transcriptional repressor FabR  25 
 
 		 202 aa  41.6  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.132494  normal  0.0684627 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1547  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 199 aa  41.6  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.58457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1607  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 199 aa  41.6  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1534  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 199 aa  41.6  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.239413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1737  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 199 aa  41.6  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.151738  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1906  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 199 aa  41.6  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 206 aa  41.6  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5376  transcriptional regulator, TetR family  24.39 
 
 		 445 aa  41.6  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>