More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5376 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5376  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 445 aa  877    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4037  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 446 aa  133  6.999999999999999e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  25.21 
 
 		 497 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 438 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4122  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 207 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  22.48 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 215 aa  57.4  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 224 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 224 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 205 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  40.48 
 
 		 246 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 238 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 207 aa  55.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 255 aa  54.7  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 266 aa  54.7  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 221 aa  55.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 247 aa  55.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 208 aa  54.3  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0719  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 408 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0260522 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3361  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 238 aa  54.3  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 224 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 208 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 219 aa  53.9  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 273 aa  53.5  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 224 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  46.27 
 
 		 218 aa  53.5  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 195 aa  53.1  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1606  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 225 aa  52.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.912424  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 224 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 226 aa  53.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27950  transcriptional regulator  32.65 
 
 		 207 aa  52.8  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00827834  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2411  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 236 aa  52.8  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 209 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 291 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1978  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 195 aa  52.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000952091  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3892  regulatory protein TetR  38.37 
 
 		 214 aa  53.1  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 224 aa  53.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 244 aa  52  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 200 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0716  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 211 aa  52.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281964  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 204 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 200 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1293  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 199 aa  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0309  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 184 aa  51.2  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.312076  normal  0.149076 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 199 aa  51.6  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 206 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 200 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 210 aa  51.2  0.00003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 209 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3662  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 191 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 200 aa  51.2  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 184 aa  51.2  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 209 aa  50.8  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  22.58 
 
 		 190 aa  50.8  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 214 aa  50.8  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6078  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  50.8  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0977252 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 222 aa  50.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 211 aa  50.8  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 218 aa  50.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 231 aa  50.4  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4455  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 215 aa  50.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0390638 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 269 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 251 aa  50.4  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1071  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 240 aa  50.4  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 228 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6452  transcriptional regulator, TetR family  25.48 
 
 		 264 aa  50.4  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 215 aa  50.4  0.00007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1403  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  50.1  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0309  transcriptional regulator, TetR family  23.88 
 
 		 213 aa  50.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.302465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1360  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 270 aa  50.1  0.00008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1019  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 200 aa  50.1  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 		 204 aa  50.1  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 190 aa  50.1  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  37.66 
 
 		 207 aa  50.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 211 aa  50.1  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 240 aa  49.7  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 200 aa  49.7  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 190 aa  50.1  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 193 aa  50.1  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 200 aa  50.1  0.00009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 200 aa  50.1  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  34.74 
 
 		 264 aa  49.7  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3060  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 230 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0482313 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2311  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 235 aa  49.3  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1774  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 231 aa  49.7  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277997  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 223 aa  49.3  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 243 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0107  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 199 aa  49.7  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.267531  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1551  transcription regulator protein  30.86 
 
 		 205 aa  49.7  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000200418  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  27.48 
 
 		 216 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 221 aa  49.3  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 213 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 213 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 217 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 224 aa  49.3  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 215 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 203 aa  48.5  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>