More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0848 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 204 aa  408  1e-113  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 222 aa  78.2  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  36.44 
 
 		 184 aa  70.1  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  39.32 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0172  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143032  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 195 aa  62  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 195 aa  62  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 201 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 209 aa  62  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 228 aa  61.6  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  25.25 
 
 		 269 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2809  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167328  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2767  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.430405  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 297 aa  58.9  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2525  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  hitchhiker  0.00170542 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2524  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000581245  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3447  regulatory protein TetR  25.43 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0228  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.728602  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  20.2 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  42.86 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2568  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21232  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2762  transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000444516 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2754  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.864254  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3746  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.29443  normal  0.952036 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3734  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3807  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.225103  normal  0.0640685 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2489  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.371609  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2904  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.349703 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  29.33 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2560  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.282393  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  38.98 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2788  TetR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000644753  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 288 aa  53.9  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 191 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 244 aa  54.3  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  26.58 
 
 		 220 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  40.26 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  26.32 
 
 		 264 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 218 aa  53.1  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 219 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.92 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>