42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3925 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3925  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  421  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.376299  normal  0.034998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6398  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 216 aa  192  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237377  normal  0.139481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2323  TetR family transcriptional regulator  49.75 
 
 		 206 aa  182  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.169023  normal  0.0173664 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1788  regulatory protein TetR  43.96 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.312966  normal  0.707323 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5615  transcriptional regulator, TetR family  42.5 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.328639  normal  0.169387 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3058  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000151008  decreased coverage  0.0000000705144 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2572  regulatory protein TetR  37.68 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 414 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 423 aa  46.2  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3625  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 191 aa  45.8  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3010  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 218 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0446  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 220 aa  45.1  0.0009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.73057 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0726  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.892311  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1382  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.117773  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5667  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 210 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 210 aa  43.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 263 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6452  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 264 aa  42.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 195 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  38.24 
 
 		 239 aa  42.4  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1713  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 210 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.312899  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 211 aa  42  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0972  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 210 aa  42  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.299865  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2325  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 210 aa  42  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 210 aa  42  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 215 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4596  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 421 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.227831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 215 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 215 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1888  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 212 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 213 aa  42  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5224  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 207 aa  42  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.123106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3584  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 212 aa  41.6  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3949  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 212 aa  41.6  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.549729 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1237  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 210 aa  41.6  0.01  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.665439 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2095  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 210 aa  41.6  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0799745 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3309  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 210 aa  41.6  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3293  regulatory protein TetR  37.68 
 
 		 208 aa  41.6  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147599  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3660  resolvase domain-containing protein  27.27 
 
 		 203 aa  41.6  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>