96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1398 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1398  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 193 aa  382  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.211037  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3788  transcriptional regulator, TetR family  44.19 
 
 		 194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.263954  normal  0.238282 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0561  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 197 aa  106  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5737  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 203 aa  104  9e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3231  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 206 aa  88.6  5e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3282  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 206 aa  88.6  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3220  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 206 aa  88.6  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2461  transcriptional regulator, TetR family  34.05 
 
 		 196 aa  85.5  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000138739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1353  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 217 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1335  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 235 aa  74.7  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1371  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 274 aa  74.3  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0478  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1745  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 243 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4718  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0123  regulatory protein, TetR  37.1 
 
 		 187 aa  68.9  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156619  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  33.81 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13278  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 211 aa  62  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.627174 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2746  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1797  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9268  putative transcriptional regulator, TetR family  34.45 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5414  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0653448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 227 aa  49.3  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 208 aa  48.9  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 202 aa  48.5  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 210 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 210 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 210 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 229 aa  48.5  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  35.34 
 
 		 192 aa  48.1  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  34.19 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2776  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 197 aa  47.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.832438  hitchhiker  0.000578318 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  31.48 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  36.21 
 
 		 232 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 218 aa  45.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 203 aa  45.1  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 223 aa  45.1  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 199 aa  44.7  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2581  regulatory protein, TetR  30.7 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1475  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 238 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.612168  normal  0.616204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6683  putative transcriptional regulator, TetR family  32.54 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  0.237194 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1508  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4281  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 208 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130087  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2169  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1486  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 227 aa  43.5  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1957  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  36 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1036  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 288 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2773  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 321 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0142  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 288 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5086  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423561  normal  0.0707297 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1313  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 321 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 206 aa  42.4  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2630  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 321 aa  42.4  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0169  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 321 aa  42.4  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.964419  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1823  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 137 aa  42.4  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000376424  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 236 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3299  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 204 aa  42  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 194 aa  42  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0441  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 233 aa  42  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2756  hypothetical protein  35.71 
 
 		 137 aa  42  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0928173 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3161  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 195 aa  42  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  34.55 
 
 		 206 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 202 aa  41.6  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 212 aa  41.6  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 235 aa  41.6  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 217 aa  41.6  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1484  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 205 aa  41.6  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 231 aa  41.6  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 222 aa  41.6  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 208 aa  41.2  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 217 aa  41.2  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  38.78 
 
 		 206 aa  41.2  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4591  regulatory protein, TetR  28.87 
 
 		 200 aa  41.2  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0937227  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3539  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 203 aa  41.2  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318561 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 200 aa  41.2  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>