160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1823 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1823  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 137 aa  280  5.000000000000001e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000376424  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2756  hypothetical protein  77.44 
 
 		 137 aa  216  7e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0928173 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1882  TetR family transcriptional regulator  76.69 
 
 		 137 aa  215  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0571882 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  38.82 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0045  transcriptional regulator  42.31 
 
 		 181 aa  49.3  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0375278  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1156  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 227 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 199 aa  47.8  0.00005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 205 aa  47.8  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0354  hypothetical protein  41.94 
 
 		 230 aa  47.4  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0313675 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3866  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 230 aa  47.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.599707  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  30.69 
 
 		 264 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 180 aa  46.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 203 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3795  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 202 aa  46.6  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277058  hitchhiker  0.000257317 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3445  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 208 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37010  transcriptional regulator  50 
 
 		 195 aa  46.2  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0348  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 198 aa  46.2  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01891  transcription regulator protein  44.68 
 
 		 219 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139537  normal  0.638618 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 206 aa  45.4  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3234  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 191 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 226 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 181 aa  45.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 208 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 224 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 243 aa  45.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 203 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 204 aa  44.7  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 237 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 225 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  38.67 
 
 		 190 aa  44.3  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 220 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 218 aa  44.7  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 213 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1404  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 193 aa  43.9  0.0007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 208 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 200 aa  43.9  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  42.31 
 
 		 212 aa  43.9  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 236 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 191 aa  43.9  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 201 aa  43.5  0.0008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 202 aa  43.5  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 236 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 222 aa  43.5  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 234 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1753  TetR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 210 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 200 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1800  TetR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 210 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.865555  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0303  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 200 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00708396  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 200 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 216 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2441  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 193 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.509096 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1734  TetR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 210 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657322  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 222 aa  42.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 200 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 438 aa  42.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 231 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 201 aa  43.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 207 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 211 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 219 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 235 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 204 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 236 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1362  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 211 aa  42.4  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 208 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 229 aa  42.4  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 234 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2015  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 203 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.997895  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  40.38 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6683  putative transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 188 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  0.237194 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 186 aa  42.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  34.48 
 
 		 188 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 239 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 203 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  32.86 
 
 		 219 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 204 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2217  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 210 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 168 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 194 aa  41.6  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 197 aa  41.6  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 227 aa  42  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003710  transcriptional regulator  30 
 
 		 262 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.485423  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  35.38 
 
 		 208 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 204 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 232 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2867  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 211 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.451195  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 235 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 223 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3373  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 193 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.946701  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 205 aa  41.2  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3435  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 193 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0970833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0202  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 186 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3384  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 193 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1775  transcriptional regulator, TetR family  26.5 
 
 		 255 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  36.54 
 
 		 205 aa  41.2  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2893  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 205 aa  41.2  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0699347  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>