More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2217 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2217  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  422  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1709  transcriptional regulator, TetR family  63.35 
 
 		 198 aa  254  5e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1845  transcriptional regulator, TetR family  48.17 
 
 		 211 aa  181  5.0000000000000004e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.025211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  24.44 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30610  transcriptional regulator  32 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 205 aa  62  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 210 aa  61.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0064  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0046  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2888  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 231 aa  58.2  0.00000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465905  normal  0.0499957 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  41.94 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3856  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3071  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3445  TetR family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2257  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.92818  normal  0.36633 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0153  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0348  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 324 aa  55.5  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  37.37 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0564  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0896844  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 248 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  38.75 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  27.19 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  23.76 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4816  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 244 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0244477 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 261 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2689  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 230 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  24.72 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38380  putative transcriptional regulator  36.92 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0126427 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40790  putative transcriptional regulator  32.86 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1656  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 182 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1564  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>