243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2015 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2015  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  413  1e-114  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.997895  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1656  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3445  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 208 aa  70.5  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3867  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53155  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  24.72 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0934  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1248  AcrR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3859  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  27.65 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  27.65 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  27.65 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  27.65 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  27.65 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  27.65 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 208 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2740  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 257 aa  51.2  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.933804 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1801  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 234 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 234 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3893  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918047  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  23.91 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0016  TetR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2853  transcriptional regulator, TetR family  25.57 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  20.71 
 
 		 203 aa  49.3  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  20.23 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  21.03 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  25.35 
 
 		 246 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0605  transcriptional regulator, TetR family  22.1 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0842361  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 261 aa  48.5  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0520  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 213 aa  48.1  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00627434 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 226 aa  48.1  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 291 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1498  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 233 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0699971 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 206 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1190  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 209 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.106163  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  21.05 
 
 		 195 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 383 aa  45.4  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 203 aa  45.1  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 217 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 206 aa  45.4  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 205 aa  45.1  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 235 aa  45.1  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3067  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 199 aa  45.1  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2627  transcriptional regulator, TetR family  25.99 
 
 		 186 aa  45.1  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  21.16 
 
 		 195 aa  45.1  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  23.44 
 
 		 212 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 205 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 205 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  27.11 
 
 		 214 aa  44.7  0.0009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0561  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  25.57 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21800  transcriptional regulator  29.79 
 
 		 265 aa  44.7  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.391718  normal  0.223847 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  18.97 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  25.42 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3127  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 187 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2332  TetR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  33 
 
 		 326 aa  44.3  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 231 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2329  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 186 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143879 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>