More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1498 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1498  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 233 aa  456  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0699971 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3445  TetR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 208 aa  90.9  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3859  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 211 aa  73.9  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3867  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53155  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 219 aa  62  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  23.88 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1656  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 206 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 256 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  24.47 
 
 		 195 aa  54.3  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1058  transcriptional regulator, TetR family  26.02 
 
 		 208 aa  54.3  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3323  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 227 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1341  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 224 aa  52.8  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 206 aa  53.1  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 246 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 195 aa  52.4  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 208 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 197 aa  52  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3211  regulatory protein, TetR  48.48 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 189 aa  51.6  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  41.94 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2015  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.997895  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 193 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  25.82 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  28.28 
 
 		 287 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 185 aa  50.1  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2493  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 239 aa  49.7  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2259  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 221 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0069  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 219 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  32.5 
 
 		 280 aa  49.7  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2500  TetR family transcriptional regulator  56.82 
 
 		 234 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3896  transcriptional regulator, TetR family  23.66 
 
 		 199 aa  49.3  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.971829  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 222 aa  49.3  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0111  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 207 aa  49.3  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.482364  normal  0.0755622 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 205 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  41.38 
 
 		 242 aa  49.3  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3981  transcriptional regulator, TetR family  23.66 
 
 		 198 aa  49.3  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000890193 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 223 aa  49.3  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 231 aa  48.9  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4015  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 239 aa  48.9  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1870  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 220 aa  48.9  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  28.98 
 
 		 196 aa  48.9  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  28.27 
 
 		 221 aa  48.9  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 205 aa  48.9  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0374  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.120665  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3257  transcriptional regulator, TetR family protein  35.71 
 
 		 195 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.696599 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 240 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2329  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 186 aa  48.5  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143879 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0304  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661097  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1684  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.46279  normal  0.0995016 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3598  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.153473  normal  0.929745 
 
 
-
 
NC_004310  BR0290  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 209 aa  48.1  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.547414  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1866  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922935  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 226 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 189 aa  48.5  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0708  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 244 aa  47.8  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003766  predicted transcriptional regulator for fatty acid degradation FadQ TetR family  31.58 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 213 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2144  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 235 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0903799 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 194 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  23.84 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 194 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  21.93 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 273 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2298  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.11047 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02639  transcriptional regulator  31.58 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3483  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 218 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 224 aa  47.4  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 194 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1660  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 235 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.903697  normal  0.835101 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>