More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2627 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_2627  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 186 aa  380  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2329  TetR family transcriptional regulator  67.74 
 
 		 186 aa  268  5e-71  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143879 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3127  TetR family transcriptional regulator  62.37 
 
 		 187 aa  258  3e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0336  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 191 aa  67.8  0.00000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.510139 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  25.7 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1601  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 241 aa  57  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  25.38 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1801  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  25.48 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  26.71 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  27.56 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 317 aa  54.3  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 228 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0111  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00780937  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26140  putative transcriptional regulator  27.54 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287141  normal  0.149256 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 200 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 231 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  29.61 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 191 aa  52  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 211 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  25.26 
 
 		 211 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 211 aa  51.6  0.000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  25.26 
 
 		 211 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  25.26 
 
 		 211 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  25.26 
 
 		 211 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  25.26 
 
 		 211 aa  51.6  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  25.26 
 
 		 211 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3702  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 204 aa  51.6  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 215 aa  51.6  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 200 aa  51.2  0.000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 209 aa  51.2  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6328  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 199 aa  51.2  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00138827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1526  transcriptional regulator, TetR family  26.36 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2292  intercellular adhesion regulator  41.51 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0364892  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 196 aa  50.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 330 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2148  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.726576 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0736  transcriptional regulator  23.48 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0112088  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  28.42 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  30.14 
 
 		 209 aa  50.4  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1369  transcriptional regulator, TetR family  28.15 
 
 		 197 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2293  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 204 aa  49.7  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3921  TetR family transcriptional regulator  23.9 
 
 		 201 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  25.65 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 220 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  42.55 
 
 		 220 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3406  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 332 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  27.84 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 200 aa  49.7  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4587  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 199 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 202 aa  49.7  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  23.97 
 
 		 214 aa  49.7  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1845  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.025211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2337  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000766652  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 208 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  24.54 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 220 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  21.08 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2746  regulatory protein TetR  41.67 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2689  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 186 aa  48.9  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 210 aa  48.9  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 208 aa  48.9  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  22.06 
 
 		 260 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 206 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  29.13 
 
 		 226 aa  48.9  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 228 aa  48.5  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 221 aa  48.5  0.00005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0611  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 203 aa  48.5  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>