More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3702 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3702  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  412  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3709  TetR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 221 aa  143  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0975739  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4298  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 233 aa  87  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.530374  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2285  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 233 aa  86.7  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.522027  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2701  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 239 aa  86.3  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1808  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 233 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2845  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1649  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 233 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3651  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 233 aa  72  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 222 aa  68.2  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  38.21 
 
 		 219 aa  64.7  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 221 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 225 aa  62.4  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 206 aa  62  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3958  transcriptional regulator, TetR family  52.73 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4003  transcriptional regulator, TetR family  52.73 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  33.93 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4802  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.96494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  37.72 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1216  HTH-type transcriptional regulator RutR  46.15 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.591915 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  36.7 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1186  HTH-type transcriptional regulator RutR  44.62 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.151745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1081  HTH-type transcriptional regulator RutR  44.62 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1196  HTH-type transcriptional regulator RutR  44.62 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  28.32 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  35.83 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1640  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1231  HTH-type transcriptional regulator RutR  44.62 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  normal  0.680174 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 224 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 271 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01016  predicted DNA-binding transcriptional regulator  44.62 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1128  transcriptional regulator RutR  44.62 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2582  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.120721 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  32.77 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1250  transcriptional regulator RutR  44.62 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2629  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2112  transcriptional regulator RutR  44.62 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2305  transcriptional regulator RutR  44.62 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 332 aa  54.7  0.0000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  33.02 
 
 		 246 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  39.39 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>