More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3709 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3709  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 221 aa  446  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0975739  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3702  TetR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2285  TetR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 233 aa  92.4  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.522027  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1649  TetR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 233 aa  89  5e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1808  TetR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 233 aa  88.6  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2845  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 233 aa  89  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2701  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 239 aa  86.7  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4298  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 233 aa  85.5  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.530374  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3651  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  48.39 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 		 221 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  39 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  39 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  39 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 226 aa  58.9  0.00000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  43.66 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 233 aa  57.4  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3163  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0140  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0158  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  46.55 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2019  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0147  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.710629  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  42.68 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  44.26 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4876  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 219 aa  54.7  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 233 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0667  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042492  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5643  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240264  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  28.79 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  48.08 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 216 aa  53.9  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2894  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3562  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 197 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3703  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00019277  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1614  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 197 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0287431  hitchhiker  0.0000000422838 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3263  transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.392887  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 211 aa  52.8  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 200 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2859  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 186 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.111234  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 214 aa  52.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3503  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1640  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 214 aa  52.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 222 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 230 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1292  regulatory protein TetR  31.91 
 
 		 231 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.413674  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 218 aa  52.4  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 317 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1454  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 231 aa  52  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 200 aa  52.4  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0511  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 225 aa  52  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 257 aa  51.6  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4199  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 214 aa  51.6  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.680761 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4951  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 239 aa  51.6  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.717286  normal  0.572747 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 204 aa  51.6  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 248 aa  51.6  0.000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2419  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.47163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3654  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 197 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.786622  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2369  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0144  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0402139  normal  0.55129 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>