More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3311 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3311  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 192 aa  378  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 193 aa  130  9e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2758  TetR family transcriptional regulator  44.51 
 
 		 231 aa  122  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3813  transcriptional regulator, TetR family  43.52 
 
 		 222 aa  115  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0327168  normal  0.449726 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3441  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 215 aa  114  6e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  39.46 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 224 aa  111  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  41.21 
 
 		 204 aa  110  9e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 383 aa  105  6e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  37.89 
 
 		 234 aa  105  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  38.5 
 
 		 228 aa  101  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 206 aa  100  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3260  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 213 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.122521  normal  0.297775 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  36.75 
 
 		 208 aa  99  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 224 aa  99  4e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 193 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4754  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 216 aa  95.1  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00853884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 192 aa  93.6  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2574  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 213 aa  91.3  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5902  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 213 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 192 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3021  TetR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 194 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49231  normal  0.167388 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 191 aa  89  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3006  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 194 aa  89  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313875  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3052  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 194 aa  89  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  37.72 
 
 		 209 aa  87.8  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  32.95 
 
 		 202 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 182 aa  86.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 185 aa  85.9  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  35.52 
 
 		 192 aa  85.9  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3021  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 210 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2623  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 209 aa  84.3  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0845142 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 230 aa  81.3  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0867  transcriptional regulator, TetR family  39.01 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8534  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 206 aa  79  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.027806  hitchhiker  0.00115544 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 206 aa  78.6  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  31.25 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1478  TetR family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 217 aa  77.8  0.00000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0873  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00991598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 214 aa  75.9  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1370  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 203 aa  75.5  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3757  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0306386  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 203 aa  73.6  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 210 aa  72  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2232  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.731324  hitchhiker  0.00520971 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4433  putative transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.304497  hitchhiker  0.00999637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8134  hypothetical protein  33.9 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.290445  normal  0.176944 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1929  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.609447 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0326  Transcriptional regulator protein  26.7 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28220  transcriptional regulator  29.38 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2430  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0075  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2475  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0521  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  32.3 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 191 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11192  transcriptional regulator  32.4 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  34.32 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 204 aa  66.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 231 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  30.25 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  43.81 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0388  transcriptional regulator, TetR family  24.04 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.654621 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3530  regulatory protein TetR  31.03 
 
 		 235 aa  64.7  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.898869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  39.77 
 
 		 194 aa  64.7  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 188 aa  63.9  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0038  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1687  regulatory protein, TetR  40.85 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2677  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0882789  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0047  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0028  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 191 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.35435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 201 aa  62  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3333  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 211 aa  62  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.618946 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1685  transcriptional regulator  28.02 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2402  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0333  regulatory protein TetR  32.18 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.104773  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>