170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0202 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0202  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 186 aa  360  7.0000000000000005e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4400  regulatory protein TetR  32.58 
 
 		 184 aa  89.4  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3271  transcriptional regulator, TetR family  33.05 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377871  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 203 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2087  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0227018  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 203 aa  49.7  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3809  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 197 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 199 aa  48.9  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4018  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  34.51 
 
 		 232 aa  48.5  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37010  transcriptional regulator  48.98 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 209 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2581  regulatory protein, TetR  32.69 
 
 		 197 aa  47.8  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.155315 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 239 aa  47.8  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1882  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 137 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0571882 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 196 aa  47  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2750  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1442  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 167 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  35.11 
 
 		 212 aa  47  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 219 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2493  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.464185 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 224 aa  46.6  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 237 aa  46.2  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 236 aa  45.8  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4249  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.399807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2756  hypothetical protein  32.94 
 
 		 137 aa  45.8  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0928173 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 234 aa  45.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3220  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3282  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3231  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 211 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 192 aa  45.4  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  27.2 
 
 		 223 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 215 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2354  regulatory protein, TetR  38.03 
 
 		 202 aa  45.4  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.291853  normal  0.0619707 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2776  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 197 aa  45.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.832438  hitchhiker  0.000578318 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2276  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 403 aa  45.1  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.276985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4773  regulatory protein TetR  34.69 
 
 		 184 aa  45.1  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550217  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0160  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  45.1  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 218 aa  45.1  0.0006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0284  regulatory protein TetR  45.76 
 
 		 215 aa  44.7  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 204 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5568  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 414 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 227 aa  43.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3455  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 245 aa  44.3  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2395  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 423 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.764783 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4718  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 260 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0561  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 200 aa  43.9  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 226 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2499  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0292579 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4135  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1335  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 235 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1353  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13278  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.627174 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3873  regulatory protein TetR  44.44 
 
 		 205 aa  43.1  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 233 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 217 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 219 aa  42.7  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4851  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12279  transcriptional regulator  32.54 
 
 		 189 aa  42.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  27.56 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>