114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1353 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1335  TetR family transcriptional regulator  99.54 
 
 		 235 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1353  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 217 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1371  TetR family transcriptional regulator  99.54 
 
 		 274 aa  433  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1745  TetR family transcriptional regulator  80.4 
 
 		 243 aa  333  1e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4718  TetR family transcriptional regulator  77.72 
 
 		 260 aa  326  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.295473 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13278  TetR family transcriptional regulator  74.75 
 
 		 211 aa  310  1e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.627174 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5737  transcriptional regulator, TetR family  38.02 
 
 		 203 aa  142  3e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2746  transcriptional regulator, TetR family  38.17 
 
 		 201 aa  140  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2461  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 196 aa  97.1  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000138739  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0561  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 197 aa  91.7  8e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3788  transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.263954  normal  0.238282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3220  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3282  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3231  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0478  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 321 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  27.56 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1156  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1398  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 193 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.211037  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4590  regulatory protein TetR  30.3 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1484  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 197 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2374  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 191 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0123  regulatory protein, TetR  34.33 
 
 		 187 aa  48.5  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.156619  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1382  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 241 aa  48.5  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0100297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4773  regulatory protein TetR  47.83 
 
 		 184 aa  48.5  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550217  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  45 
 
 		 202 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3234  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4086  putative transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1486  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0956  transcriptional regulator  23.01 
 
 		 177 aa  46.2  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0752812  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0566  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1508  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  46.34 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 229 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  29.59 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 		 233 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  27.64 
 
 		 182 aa  45.4  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4203  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 201 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.428203  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4269  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 201 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.650224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4430  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 201 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 223 aa  45.1  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  26.43 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5058  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5146  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0372  TetR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462449 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4272  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  26.43 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  26.43 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  26.43 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  26.43 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5437  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  26.43 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 234 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1681  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 216 aa  45.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.977422 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 186 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2346  hypothetical protein  29.59 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0202  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4281  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130087  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3299  regulatory protein, TetR  44.19 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  21.9 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  23.67 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25250  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.862967  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_126  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0747  TetR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  23.47 
 
 		 200 aa  43.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3973  regulatory protein TetR  30.16 
 
 		 204 aa  43.5  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7183  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 219 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902217 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3553  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 202 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.500909  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3626  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 202 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.757995 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3558  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 202 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.267611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4309  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 209 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 191 aa  42.7  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  23.74 
 
 		 207 aa  42.7  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35780  TetR family regulatory protein  28.08 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 195 aa  42.4  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 235 aa  42.4  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 255 aa  42.4  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  26.03 
 
 		 227 aa  42.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 208 aa  42  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 193 aa  42.4  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 209 aa  42.4  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 203 aa  42  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 400 aa  42.4  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  26.72 
 
 		 237 aa  42  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>