118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4430 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4203  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  390  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.428203  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4269  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  390  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.650224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4430  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  390  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3735  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 202 aa  162  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3306  regulatory protein TetR  48.35 
 
 		 189 aa  143  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000516611  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4929  putative transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.182818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5332  putative transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.780657 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2667  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4401  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00379703  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1353  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 217 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.299374  normal  0.776591 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  28 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06720  transcriptional regulator, tetR family  27.72 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.172688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4678  transcriptional regulator, TetR family  24.12 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000014554  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1335  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 235 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2401  TetR family transcriptional regulator  19.46 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.148693  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2447  regulatory protein TetR  19.46 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00212312  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0559  transcriptional regulator, TetR family  24.12 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000271654  hitchhiker  2.35635e-17 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 190 aa  46.6  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1371  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 274 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  27.75 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5306  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 219 aa  45.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.190126 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 199 aa  45.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3983  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 200 aa  45.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 195 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 195 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 195 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3256  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.20288  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 207 aa  45.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5062  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 208 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 212 aa  44.7  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  22.35 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4466  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00176628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4301  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000465082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4312  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0243746  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4814  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00735833  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1587  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1611  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1557  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873387  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4694  transcriptional regulator, TetR family  22.94 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000803209  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4685  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.17076e-49 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7871  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal  0.175428 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2937  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0946  TetR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.611956  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0118  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.980303  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 234 aa  43.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  25.96 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  32.22 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  37.18 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0887  TetR family transcriptional regulator  19.02 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 216 aa  42.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0943  TetR family transcriptional regulator  19.02 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0015  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13278  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.627174 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0778  transcriptional regulator BetI  38.6 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.576335  normal  0.0961486 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1027  transcriptional regulator, TetR-related family  19.02 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.34456e-23 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3500  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.711575  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0891  transcriptional regulator BetI  38.6 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.21263  normal  0.810171 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  34.78 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 202 aa  42.4  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0128  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 196 aa  42.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.168138  normal  0.0601393 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 200 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3251  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 219 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.831278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 197 aa  42.4  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 209 aa  42.4  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4773  regulatory protein TetR  36.54 
 
 		 184 aa  42.4  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550217  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 222 aa  42  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1114  transcriptional regulator, TetR-related family  20 
 
 		 191 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4326  transcriptional regulator, TetR-related family  19.64 
 
 		 191 aa  42.4  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 194 aa  42.4  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 222 aa  42  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1745  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 243 aa  42  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 206 aa  42  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0858  regulatory protein TetR  39.24 
 
 		 201 aa  42  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00117784  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 203 aa  42  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 205 aa  42  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2683  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 219 aa  42  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0774408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3795  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 202 aa  42  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.277058  hitchhiker  0.000257317 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  29.09 
 
 		 226 aa  42  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 196 aa  42  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 211 aa  41.6  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>