More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1453 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_1453  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 183 aa  375  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  40.66 
 
 		 188 aa  161  6e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  43.17 
 
 		 196 aa  160  9e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  37.08 
 
 		 195 aa  118  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 198 aa  72.8  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2529  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3238  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.210945  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0884  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0708225  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1133  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 191 aa  67.8  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6328  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00138827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 201 aa  67  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5597  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5582  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 198 aa  65.9  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5004  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0270987  normal  0.0251839 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 192 aa  64.7  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  24.4 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1980  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5096  transcriptional regulator, TetR family  23.33 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841888  normal  0.375957 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  23.32 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 202 aa  60.1  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  25.26 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4587  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4082  transcriptional regulator, TetR family  24.28 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.129417  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4097  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  23.43 
 
 		 197 aa  58.5  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0583  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 205 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 212 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 212 aa  57  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 		 205 aa  57  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  22.58 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  23.84 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  21.51 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1097  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4307  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0504608 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  21.81 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  24.07 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  21.93 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3375  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0881  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  26.2 
 
 		 195 aa  54.3  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0875  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0892  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  26.2 
 
 		 194 aa  54.3  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  21.98 
 
 		 193 aa  54.3  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 211 aa  54.3  0.0000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5712  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3433  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 193 aa  53.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.389542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5097  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2295  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 204 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  23.04 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1146  TetR family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.390773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1841  transcriptional regulator, TetR family protein  26.62 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2431  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.547738  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5917  TetR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.640474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 213 aa  52.4  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5463  transcriptional regulator, TetR family  25.67 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 183 aa  52.4  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0097  TetR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 188 aa  52.4  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  24.16 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  20.65 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1418  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 196 aa  52  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 199 aa  52  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  22.1 
 
 		 197 aa  52  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  23.46 
 
 		 209 aa  51.6  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 186 aa  51.6  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 213 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 213 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  23.86 
 
 		 191 aa  51.6  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 202 aa  51.2  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>