More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0039 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_0039  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 201 aa  399  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4596  regulatory protein TetR  47.64 
 
 		 196 aa  155  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2067  transcriptional regulator, TetR family  38.61 
 
 		 213 aa  118  4.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.580158 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1950  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 240 aa  115  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663338  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  35.6 
 
 		 206 aa  107  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 		 198 aa  107  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  37.24 
 
 		 211 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22560  transcriptional regulator, tetR family  34.04 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0880115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1914  transcriptional regulator, TetR family  34.47 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2079  transcriptional regulator, TetR family  33.76 
 
 		 208 aa  73.9  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.674297  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4996  transcriptional regulator  27.81 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4968  transcriptional regulator, TetR family domain protein  28.19 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2290  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0794358  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  32.2 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0403  transcriptional regulator BetI  26.67 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5113  transcriptional regulator BetI  27.88 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0491395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  31.53 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  31.53 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  31.53 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  31.53 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  31.53 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  31.53 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4935  transcriptional regulator BetI  27.27 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5242  transcriptional regulator BetI  26.06 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  31.53 
 
 		 195 aa  57  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0483  transcriptional regulator BetI  27.88 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2556  transcriptional regulator BetI  30.63 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.160785  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  43.55 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5035  transcriptional regulator BetI  25.99 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  25.99 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0440  regulatory protein BetI  26.06 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  25.16 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  27.97 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4734  transcriptional regulator BetI  26.06 
 
 		 197 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.448537 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  24.68 
 
 		 194 aa  52  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  25.42 
 
 		 194 aa  51.6  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  51.6  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0268  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  29.41 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  26.32 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  26.81 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2129  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 181 aa  49.7  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 228 aa  49.7  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  24.86 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  24.86 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  21.94 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  21.94 
 
 		 189 aa  49.7  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  24.86 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 242 aa  49.7  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3538  transcriptional regulator BetI  26.4 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6159  transcriptional regulator BetI  28.33 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0611  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 248 aa  48.9  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  21.74 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70970  transcriptional regulator BetI  28.33 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.790986 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1470  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.772741  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 234 aa  48.5  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0520  TetR family transcriptional regulator  22.1 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00627434 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2058  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00904468  normal  0.0313266 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 212 aa  48.1  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4773  regulatory protein TetR  31.3 
 
 		 184 aa  48.1  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550217  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1074  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 213 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  hitchhiker  0.00943768 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 235 aa  48.1  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1739  tetracycline transcriptional regulator YcdC domain-containing protein  34.78 
 
 		 213 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2214  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 219 aa  48.1  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.411668  normal  0.665917 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 231 aa  48.1  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1005  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 218 aa  48.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8404  putative transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 677 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  24.1 
 
 		 308 aa  47.4  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  25.64 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1332  transcriptional regulator BetI  26.27 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.945819  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 217 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  44.68 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1904  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.550528  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2803  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.014286  normal  0.214284 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3451  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 217 aa  46.6  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  37.25 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 238 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  30.88 
 
 		 217 aa  46.6  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3361  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 238 aa  46.6  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3314  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>