249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_18410 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_18410  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 181 aa  357  6e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.238417 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3582  transcriptional regulator, TetR family  66.08 
 
 		 187 aa  221  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  56.73 
 
 		 181 aa  182  3e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  55.17 
 
 		 197 aa  177  4.999999999999999e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2126  transcriptional regulator, TetR family  61.59 
 
 		 204 aa  176  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  50.56 
 
 		 240 aa  166  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3979  transcriptional regulator, TetR family  61.44 
 
 		 203 aa  159  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  46.01 
 
 		 185 aa  147  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0873  TetR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 178 aa  133  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0918  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 178 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2499  transcriptional regulator, TetR family  41.25 
 
 		 178 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0999  transcriptional regulator, TetR family  41.25 
 
 		 178 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2796  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 178 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.117516  normal  0.243308 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00813  predicted DNA-binding transcriptional regulator  41.25 
 
 		 178 aa  131  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.270779  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2796  transcriptional regulator, TetR family  41.25 
 
 		 178 aa  131  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.398531  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00830  hypothetical protein  41.25 
 
 		 178 aa  131  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.295036  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0908  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 178 aa  131  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0778822  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0973  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 206 aa  127  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0941  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 206 aa  127  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1002  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 186 aa  127  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1021  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 206 aa  127  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.163661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0905  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 206 aa  127  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22570  hypothetical protein  43.03 
 
 		 193 aa  126  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.487793  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4304  transcriptional regulator, TetR family  40.99 
 
 		 187 aa  123  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.498529  normal  0.0930958 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2089  transcriptional regulator, TetR family  39.87 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.850407  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2375  transcriptional regulator, TetR family  38.56 
 
 		 184 aa  116  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90143  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  28.57 
 
 		 189 aa  65.5  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  31.45 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4038  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 166 aa  57  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.796052  normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13083  DeoR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2264  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0218044  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 414 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0096  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  32.12 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 199 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 202 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 218 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  24.4 
 
 		 198 aa  52  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4952  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 203 aa  52  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.150878 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  27.07 
 
 		 198 aa  51.6  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6891  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 196 aa  51.2  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0140  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 192 aa  51.2  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 241 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  40.85 
 
 		 241 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6235  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 230 aa  51.2  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.319409  normal  0.706195 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1497  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 238 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.11015  normal  0.986291 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1507  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 220 aa  50.4  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4120  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 234 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1102  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 234 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4225  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 234 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4528  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 172 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2006  regulatory protein TetR  55.81 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2237  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 236 aa  49.7  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1681  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 225 aa  49.7  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.296499  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4569  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.591722  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 192 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4657  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.287751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1138  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 248 aa  50.1  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0039  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 201 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4596  regulatory protein TetR  38.27 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  24.22 
 
 		 428 aa  49.3  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1439  putative transcriptional regulator  36.62 
 
 		 237 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1914  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 239 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2383  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 218 aa  49.3  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360847 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 206 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 212 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0901  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 236 aa  48.9  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  28.02 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  26.92 
 
 		 195 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  26.92 
 
 		 195 aa  48.5  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3369  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 237 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.15346  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39380  TetR family regulatory protein  38.81 
 
 		 237 aa  48.1  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127312  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  35.48 
 
 		 210 aa  48.5  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1720  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 221 aa  48.5  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000768968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 211 aa  48.1  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 415 aa  48.1  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  35.48 
 
 		 210 aa  48.5  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1061  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 234 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.464557  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 207 aa  48.1  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2086  putative transcription regulator protein  29.27 
 
 		 231 aa  47.8  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07310  hypothetical protein  40.3 
 
 		 247 aa  47.8  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.608576  normal  0.0646934 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  38.46 
 
 		 198 aa  47.8  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 218 aa  47.8  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3893  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 194 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1789  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.461504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16550  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 237 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 208 aa  47  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2410  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1074  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 184 aa  46.2  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>