More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0628 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0628  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 262 aa  522  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0323336 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0593  TetR family transcriptional regulator  62.84 
 
 		 268 aa  278  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.65008  normal  0.136354 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 224 aa  122  5e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4182  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 201 aa  91.7  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.368627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1991  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645683  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2010  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2056  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4203  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 216 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0570722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4118  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 181 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2227  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192949  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2028  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 206 aa  57  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 259 aa  57  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 205 aa  57  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6467  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 217 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4573  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4661  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2990  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 194 aa  55.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 74 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 222 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4956  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 197 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0932682 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  21.79 
 
 		 236 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 213 aa  53.9  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 202 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 211 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5152  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 206 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  31.03 
 
 		 204 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 230 aa  53.5  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 212 aa  53.1  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 182 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  33.67 
 
 		 258 aa  53.1  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 223 aa  52.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 244 aa  52.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 219 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 214 aa  52.4  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 222 aa  52.4  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 205 aa  52.4  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3465  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 217 aa  52  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 194 aa  52  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1007  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 194 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.587433  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3516  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 199 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  31.03 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 196 aa  51.6  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146337 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5130  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1606  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.752317  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3253  transcriptional regulator  32.91 
 
 		 194 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0516477  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  32.47 
 
 		 230 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0727  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 216 aa  51.2  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 222 aa  51.2  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 208 aa  50.8  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  51.2  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  34.74 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 199 aa  51.2  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2937  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 222 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0118  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 222 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.980303  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 232 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 193 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0026  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 194 aa  50.4  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.348467  normal  0.209562 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 238 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  29.29 
 
 		 202 aa  50.4  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 194 aa  49.7  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 233 aa  50.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21540  transcriptional regulator  32.88 
 
 		 187 aa  50.1  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2013  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 173 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2059  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 173 aa  50.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.045167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 212 aa  49.7  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4561  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.286179  normal  0.0846577 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 222 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 228 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 227 aa  49.3  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1351  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 212 aa  49.3  0.00006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  29.92 
 
 		 186 aa  49.3  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3856  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  49.3  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1994  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 173 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187018  normal  0.996586 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 213 aa  49.3  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 183 aa  49.3  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 211 aa  48.9  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 206 aa  48.9  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
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NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  30.21 
 
 		 211 aa  48.9  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  30.21 
 
 		 211 aa  48.9  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
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