220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1991 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2010  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 184 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2056  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 184 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1991  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 184 aa  375  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645683  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4118  TetR family transcriptional regulator  76.63 
 
 		 181 aa  283  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2227  TetR family transcriptional regulator  76.8 
 
 		 180 aa  281  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192949  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2013  TetR family transcriptional regulator  64.46 
 
 		 173 aa  221  6e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2059  TetR family transcriptional regulator  64.46 
 
 		 173 aa  221  6e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.045167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1994  TetR family transcriptional regulator  63.86 
 
 		 173 aa  219  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187018  normal  0.996586 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  59.89 
 
 		 183 aa  218  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  61.29 
 
 		 187 aa  208  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0628  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 262 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0323336 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0593  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 268 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.65008  normal  0.136354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4203  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 216 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0570722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 236 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4182  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.368627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 224 aa  52.8  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 194 aa  51.6  0.000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 213 aa  50.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 224 aa  50.4  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 		 264 aa  50.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 237 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 185 aa  48.9  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 197 aa  48.5  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 227 aa  48.5  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 324 aa  48.5  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 191 aa  48.5  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 194 aa  47.8  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 438 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 233 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1507  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 224 aa  47  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0289697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 228 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 211 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  43.55 
 
 		 211 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 211 aa  46.2  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 209 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3973  regulatory protein TetR  35.71 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3220  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 206 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 226 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3282  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 206 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0688565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  42.11 
 
 		 232 aa  46.2  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2776  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.556184  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 247 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  43.55 
 
 		 211 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  43.55 
 
 		 211 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  43.55 
 
 		 211 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  43.55 
 
 		 211 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3231  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 206 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.140653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  43.55 
 
 		 211 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5272  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0566  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 206 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 203 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 231 aa  45.4  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 190 aa  45.4  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 213 aa  45.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 229 aa  45.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 234 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 224 aa  45.4  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0411  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 196 aa  45.8  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.3269  hitchhiker  0.00212654 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 234 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0290  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 198 aa  45.4  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 213 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 201 aa  45.4  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1448  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 182 aa  45.4  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0355171  normal  0.193745 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 400 aa  45.1  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2281  transcriptional regulator, TetR family  52.27 
 
 		 215 aa  45.4  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 213 aa  45.1  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 206 aa  45.1  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2670  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 214 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.545748  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2715  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 214 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  0.0320009 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2700  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 200 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4096  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 201 aa  45.1  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428343  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  33.07 
 
 		 203 aa  44.7  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3529  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 220 aa  45.1  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.270662  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 207 aa  44.7  0.0007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1137  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 193 aa  44.7  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 214 aa  44.7  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 217 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 243 aa  44.7  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 261 aa  44.3  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5327  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0703  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 216 aa  43.9  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5170  TetR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1245  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 203 aa  43.9  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5259  TetR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.532008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2056  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 253 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391496 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5551  TetR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>