164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1606 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1606  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  404  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.752317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5152  TetR family transcriptional regulator  88 
 
 		 206 aa  337  5e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4956  TetR family transcriptional regulator  70.05 
 
 		 197 aa  281  5.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0932682 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4573  TetR family transcriptional regulator  69.54 
 
 		 197 aa  278  3e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4661  TetR family transcriptional regulator  69.54 
 
 		 197 aa  278  3e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4911  TetR family transcriptional regulator  52.82 
 
 		 206 aa  203  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3973  regulatory protein TetR  51.76 
 
 		 204 aa  199  3e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0372  TetR family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 211 aa  184  6e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462449 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4281  TetR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 208 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130087  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1484  TetR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 205 aa  172  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1486  TetR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1508  TetR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 205 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0364  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113387 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3553  TetR family transcriptional regulator  45.13 
 
 		 202 aa  164  9e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.500909  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3626  TetR family transcriptional regulator  45.13 
 
 		 202 aa  164  9e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.757995 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3558  TetR family transcriptional regulator  45.13 
 
 		 202 aa  164  9e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.267611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3496  TetR family transcriptional regulator  45.41 
 
 		 220 aa  161  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2465  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 202 aa  142  4e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3011  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 214 aa  136  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0859343 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4096  TetR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 201 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428343  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2232  TetR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.347192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4113  TetR family transcriptional regulator  40.72 
 
 		 204 aa  119  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185648  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 228 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4083  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.843798  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0628  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 262 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0323336 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  31.07 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 229 aa  51.6  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2936  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 266 aa  49.7  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.273782 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 200 aa  48.5  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  43.24 
 
 		 228 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4203  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 216 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0570722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7183  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 219 aa  48.1  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00902217 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  36.14 
 
 		 227 aa  48.1  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  43.24 
 
 		 208 aa  48.1  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 198 aa  48.1  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  36.73 
 
 		 280 aa  47.8  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 233 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4182  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.368627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  41.89 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0703  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 		 216 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4590  regulatory protein TetR  29.03 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0566  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2762  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0636  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 250 aa  45.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0304513 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0045  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 181 aa  45.8  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0375278  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 212 aa  45.4  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 200 aa  45.1  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  48.89 
 
 		 209 aa  45.1  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 242 aa  45.1  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 219 aa  45.1  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  24.34 
 
 		 308 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3432  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0339823  normal  0.853068 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 243 aa  44.3  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 206 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13891  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34880  transcriptional regulator, tetR family  31.78 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1572  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6259  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 219 aa  43.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0963  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553529  normal  0.247244 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1076  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.581791 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6735  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 215 aa  43.1  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  39.34 
 
 		 205 aa  43.5  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22990  transcriptional regulator  42.25 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0933864  normal  0.028216 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 241 aa  42.7  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>