More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0928 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 184 aa  349  2e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 210 aa  72  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 		 176 aa  67.8  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 232 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 203 aa  57.8  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  35.93 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1275  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0714777  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  33.81 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2994  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0429  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3553  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.500909  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3626  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.757995 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3558  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.267611  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  43.02 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 174 aa  54.7  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 203 aa  54.3  0.0000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 173 aa  54.3  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 188 aa  54.3  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4250  TetR family transcriptional regulator  34.64 
 
 		 196 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0141169  normal  0.0239439 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0287  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 181 aa  54.3  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04680  transcriptional regulator  33.58 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 188 aa  53.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 214 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1889  transcriptional regulator, TetR family  24.58 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.2019  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0523  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2759  LacI family transcription regulator  32.3 
 
 		 198 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  48.68 
 
 		 202 aa  52.4  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2997  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_1770  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 203 aa  52  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3457  transcriptional regulator, TetR family  24.58 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  hitchhiker  4.55485e-18 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5370  TetR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 187 aa  52  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2776  transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 213 aa  52  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1382  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 217 aa  52  0.000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 184 aa  52  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 189 aa  51.6  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  41.89 
 
 		 174 aa  52  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 188 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 188 aa  51.6  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 188 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 188 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 195 aa  51.6  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 179 aa  51.6  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 188 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 205 aa  51.6  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  45.33 
 
 		 190 aa  51.6  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  64.44 
 
 		 207 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  23.18 
 
 		 190 aa  51.2  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 187 aa  51.2  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  51.2  0.000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  23.38 
 
 		 192 aa  51.2  0.000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 		 196 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3386  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60860  transcriptional regulator NfxB  29.38 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  23.87 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 218 aa  50.4  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 180 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  22.46 
 
 		 212 aa  50.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0835  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.861936  normal  0.897725 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 212 aa  49.7  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  25.48 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  26.25 
 
 		 195 aa  49.7  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3493  transcriptional regulator, TetR family  25.5 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 241 aa  49.7  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1469  regulatory protein TetR  55.81 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.520835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5859  transcriptional regulatory protein NfxB  29.37 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.731668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 192 aa  49.3  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0423  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.567311  n/a   
 
 
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NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 193 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0935  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 199 aa  49.3  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008688  Pden_4802  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 199 aa  49.3  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.386552  normal  0.120275 
 
 
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NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  30.87 
 
 		 182 aa  49.7  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
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NC_013172  Bfae_25250  transcriptional regulator  28.33 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.862967  n/a   
 
 
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NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 218 aa  49.3  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
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NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  51.06 
 
 		 227 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
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NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 192 aa  49.3  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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