273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4113 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4113  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  401  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.185648  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2232  TetR family transcriptional regulator  77.94 
 
 		 204 aa  291  6e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.347192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4096  TetR family transcriptional regulator  54 
 
 		 201 aa  199  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428343  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4911  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 206 aa  145  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3973  regulatory protein TetR  40.5 
 
 		 204 aa  134  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4956  TetR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 197 aa  125  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0932682 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4573  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 197 aa  124  9e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4661  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 197 aa  124  9e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5152  TetR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 206 aa  119  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1606  TetR family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 203 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.752317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0372  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462449 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3553  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.500909  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3558  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.267611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3626  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.757995 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4281  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 208 aa  108  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130087  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3496  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 220 aa  105  5e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1484  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 205 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1486  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 205 aa  101  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1508  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 205 aa  101  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0364  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 220 aa  97.8  9e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113387 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3011  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 214 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0859343 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2465  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 202 aa  89.4  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0366  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 232 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.024079 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 236 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  44.26 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4083  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 214 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.843798  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0741  regulatory protein, TetR  39.44 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0369  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87327 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4178  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 236 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.708717 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 220 aa  48.9  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 209 aa  48.9  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 216 aa  48.9  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 209 aa  48.5  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 206 aa  48.5  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 206 aa  48.5  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 216 aa  48.5  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3133  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 208 aa  48.1  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3234  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 191 aa  48.1  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 216 aa  48.1  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 200 aa  48.1  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 191 aa  48.1  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 210 aa  48.1  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2560  transcriptional regulator, TetR family  41.56 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199189  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5327  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4666  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.243183 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0733  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0614739  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2516  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0144  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 181 aa  46.6  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0747  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.15327 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0727  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329451 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1507  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0289697  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4962  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0320648  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  27.27 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3428  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 223 aa  45.8  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0832031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  29.69 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 236 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 220 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  24.67 
 
 		 195 aa  45.8  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2010  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 184 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 208 aa  45.8  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2056  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 184 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 190 aa  45.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1991  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 184 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645683  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 197 aa  45.4  0.0006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 246 aa  45.4  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2026  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 218 aa  45.4  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.148832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 197 aa  45.4  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 217 aa  45.1  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 219 aa  45.1  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 220 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  40.38 
 
 		 206 aa  45.1  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 225 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>