76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3133 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3133  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 204 aa  402  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 233 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6809  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 178 aa  50.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.318139  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 210 aa  49.7  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0085  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 219 aa  48.5  0.00007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3853  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 213 aa  48.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.26442  normal  0.765649 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3967  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 213 aa  48.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0630357 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0857  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.755905  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0863  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0874  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  24.86 
 
 		 232 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 216 aa  45.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 212 aa  45.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 206 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 206 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 196 aa  45.1  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2898  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 206 aa  45.1  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.881728  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 205 aa  45.1  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0404  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 207 aa  44.7  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 206 aa  44.7  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 197 aa  44.7  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0430  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.469108 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0186  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 410 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.291821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 233 aa  44.7  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0727  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.329451 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2940  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0733  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0614739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0747  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.15327 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2807  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3614  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19500  transcriptional regulator, tetR family  34.55 
 
 		 181 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1735  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0031  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  43.33 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03014  putative transcription regulator protein  40 
 
 		 216 aa  43.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.262128 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 215 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3566  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.730164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 236 aa  42.7  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 208 aa  42.7  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 197 aa  42.4  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 202 aa  42.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4412  transcriptional regulator, TetR family  51.16 
 
 		 252 aa  42.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4166  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 191 aa  42.4  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1789  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 203 aa  42.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 196 aa  42  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 236 aa  42  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 212 aa  42  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2490  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 200 aa  42  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375188  normal  0.286749 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2816  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 192 aa  41.6  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 218 aa  42  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 187 aa  42  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5272  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 195 aa  41.6  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 200 aa  41.6  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  37.68 
 
 		 202 aa  41.2  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 199 aa  41.2  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>