70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0874 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0857  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 181 aa  350  5e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.755905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0874  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 181 aa  350  5e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0863  TetR family transcriptional regulator  98.9 
 
 		 181 aa  346  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0437  TetR family transcriptional regulator  49.4 
 
 		 176 aa  134  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19500  transcriptional regulator, tetR family  36.78 
 
 		 181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0230  TetR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 189 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.971783  normal  0.1295 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1248  AcrR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  29.68 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3818  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 		 205 aa  51.6  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 188 aa  51.2  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 193 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  25.61 
 
 		 199 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 203 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1035  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1025  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 214 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.589531  normal  0.553747 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2827  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 186 aa  49.7  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.05215  normal  0.803833 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1008  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 214 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.535946  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1327  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 204 aa  49.7  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 230 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 201 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 188 aa  48.5  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2851  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 204 aa  48.5  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1030  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.468417  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 191 aa  48.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0706  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 383 aa  47.8  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 213 aa  47.8  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3133  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 204 aa  47.8  0.00009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 202 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2727  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.109313 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 223 aa  46.2  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3225  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 213 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.314279  normal  0.210871 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3394  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222962 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 206 aa  45.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5159  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 202 aa  45.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3190  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 202 aa  45.1  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000548437  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  33.06 
 
 		 208 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1531  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 200 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  29.52 
 
 		 211 aa  44.7  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  24.52 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1434  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1561  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.478798  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1585  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 200 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  40.54 
 
 		 213 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  26.97 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 200 aa  42.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0830  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 195 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5338  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 213 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.220511  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0153  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 193 aa  42  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 200 aa  42.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5427  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 213 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.926308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5054  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 207 aa  41.6  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.817621 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  38.71 
 
 		 191 aa  41.6  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 202 aa  41.6  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 230 aa  41.6  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 210 aa  41.6  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05420  transcriptional regulator, tetR family  30.95 
 
 		 188 aa  41.2  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  27.34 
 
 		 202 aa  41.6  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4141  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 243 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  26.67 
 
 		 227 aa  41.2  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 297 aa  41.2  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 200 aa  40.8  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 205 aa  40.8  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>