169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_19500 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_19500  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 181 aa  351  2.9999999999999997e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0863  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 181 aa  116  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0857  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.755905  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0874  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0437  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 176 aa  103  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.383719 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0230  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.971783  normal  0.1295 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3270  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 245 aa  70.9  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1248  AcrR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  38.32 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2959  transcriptional regulator, TetR family  37.13 
 
 		 200 aa  67  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1252  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0581191  normal  0.11609 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2851  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4219  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 203 aa  57  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4348  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  27.5 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  28.73 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0893  regulatory protein TetR  27.74 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1961  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.797544  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 205 aa  52.4  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 223 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0845  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 200 aa  52  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4818  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 208 aa  51.6  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.945526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  23.63 
 
 		 199 aa  51.6  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5564  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 		 201 aa  51.6  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6035  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 203 aa  51.2  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  27.07 
 
 		 204 aa  50.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0014  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 234 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.730336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  43.42 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 200 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 200 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 247 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 206 aa  49.3  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1275  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 214 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  27.56 
 
 		 202 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3140  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 230 aa  48.5  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 		 185 aa  48.5  0.00006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 199 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3528  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.069513  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0194  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 193 aa  47  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7472  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 228 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2450  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 213 aa  46.2  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  22.11 
 
 		 197 aa  46.2  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 216 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3569  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 217 aa  45.8  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.773564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0061  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 224 aa  45.8  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 216 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 216 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5107  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 225 aa  45.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.346129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2827  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 186 aa  45.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.05215  normal  0.803833 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 208 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1556  putative transcriptional regulator, TetR family  48.89 
 
 		 182 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3683  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 193 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.14289  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 255 aa  45.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2332  regulatory protein, TetR  23.16 
 
 		 204 aa  45.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000899921 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1684  regulatory protein TetR  23.9 
 
 		 211 aa  45.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.817144  normal  0.172233 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 247 aa  45.4  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0872  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 212 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.83423  normal  0.281851 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 205 aa  45.1  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 264 aa  45.1  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3394  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 220 aa  45.1  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.222962 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1541  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 191 aa  45.1  0.0006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 206 aa  45.1  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 206 aa  45.1  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 266 aa  44.7  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0640  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 235 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.346756  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 206 aa  44.7  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0653  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 235 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.553642  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0633  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 235 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0416702 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0180  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 193 aa  44.7  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0296493  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0183  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 193 aa  44.7  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  26.29 
 
 		 211 aa  44.7  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 215 aa  44.7  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14850  transcriptional regulator  27.01 
 
 		 224 aa  44.7  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.126744 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0212  transcription regulator TetR/AcrR family protein  32.79 
 
 		 193 aa  44.3  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 273 aa  44.3  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 287 aa  44.3  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3148  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 231 aa  43.9  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.647957  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5223  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 197 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.325156 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2309  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.601552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 268 aa  43.9  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  34.38 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3133  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.129954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>