91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1541 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1541  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  383  1e-106  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  31.89 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4006  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 193 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.685052  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12279  transcriptional regulator  33.09 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000321459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7526  putative transcriptional regulator, TetR family  46.97 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1474  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2394  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.469906  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5615  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000827938  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5979  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000443748  hitchhiker  0.000881636 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2221  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 233 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 203 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 194 aa  51.6  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1528  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 194 aa  51.2  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.680556  normal  0.906011 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2963  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.412295 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1975  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382484  normal  0.828211 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  31.31 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 227 aa  49.7  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7144  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.251131 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4496  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 202 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0468943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0602  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 209 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1697  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 230 aa  48.5  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 202 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6626  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 210 aa  48.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0303  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 200 aa  47.8  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00708396  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2682  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0327111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0691  regulatory protein TetR  41.38 
 
 		 202 aa  47  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 213 aa  47  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4073  putative transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.134392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2652  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0884  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 237 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.214434 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2992  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.385096  normal  0.373192 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2697  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.312459  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2948  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5089  putative transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 245 aa  46.2  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2792  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 248 aa  45.8  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.41359  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4685  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1237  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 219 aa  45.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.689055  normal  0.0835458 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2906  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0722139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 203 aa  45.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19500  transcriptional regulator, tetR family  26.23 
 
 		 181 aa  45.1  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64021  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3915  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 215 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3623  regulatory protein TetR  34 
 
 		 193 aa  45.1  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.755125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3287  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 195 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.443656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  29.5 
 
 		 232 aa  44.7  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4434  transcriptional regulator  33.66 
 
 		 203 aa  44.7  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.147694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2851  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2012  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.719864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2593  putative transcriptional regulator, TetR family  25.76 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0854341 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2768  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 192 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3234  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 195 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2696  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 186 aa  43.1  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000528624  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5321  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 184 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.868815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0278  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 206 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.72994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5233  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 184 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.494471  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2606  transcriptional regulator, TetR family  24.56 
 
 		 209 aa  42.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.417971  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 189 aa  42.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7464  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 200 aa  42.4  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0288781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 218 aa  42.4  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5613  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 184 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  0.405211 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2555  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 205 aa  42  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4993  transcriptional regulator, TetR family  24 
 
 		 202 aa  42  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.309228 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3536  putative transcriptional regulator  30.67 
 
 		 191 aa  42  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1870  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 200 aa  42.4  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 185 aa  41.6  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5818  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 216 aa  42  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.199964  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 217 aa  42  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 191 aa  42  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  20.73 
 
 		 191 aa  42  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3435  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 193 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0970833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3384  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 193 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3373  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 193 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.946701  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1763  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 287 aa  41.6  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000686866 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4158  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 205 aa  41.2  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.000188504  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8534  transcriptional regulator, TetR family  25.43 
 
 		 206 aa  41.6  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.027806  hitchhiker  0.00115544 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0409  TetR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 214 aa  41.6  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3036  TetR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 196 aa  41.2  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  25.45 
 
 		 224 aa  41.2  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2430  regulatory protein LacI  24.86 
 
 		 185 aa  41.2  0.01  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.633892  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>