72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2768 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2768  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 192 aa  371  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8493  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 180 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  35.39 
 
 		 232 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1889  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 194 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.2019  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3457  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 194 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  hitchhiker  4.55485e-18 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0473  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0495  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.595524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0484  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 180 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 		 189 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1275  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0714777  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6310  putative transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.523655  normal  0.0800729 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4325  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 185 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670247 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1664  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354997  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3350  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2776  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 206 aa  57.8  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2820  transcriptional regulator NfxB  29.81 
 
 		 185 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5333  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14890  transcriptional regulator, tetR family  26.92 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0325223  normal  0.0343336 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1327  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3660  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.880035  normal  0.502238 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1301  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.365782  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1734  transcriptional regulator NfxB  30.69 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.413986 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2000  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3155  regulatory protein TetR  22.83 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0429  transcriptional regulator, TetR family  26.59 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00232  hypothetical protein  29.17 
 
 		 192 aa  49.3  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3690  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 191 aa  48.9  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.225915 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0287  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 181 aa  49.3  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  33.75 
 
 		 326 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2759  LacI family transcription regulator  24.21 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4863  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.878301  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3104  TetR family transcriptional regulator  19.89 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1967  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0188577  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 176 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 199 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 195 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3493  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 196 aa  44.7  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60860  transcriptional regulator NfxB  26.67 
 
 		 187 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 196 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 256 aa  44.7  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5241  transcriptional regulator NfxB  25.95 
 
 		 199 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2098  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0785695  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  29.34 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3793  regulatory protein TetR  52.63 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2430  regulatory protein LacI  25.57 
 
 		 185 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.633892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4153  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 201 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0444312  normal  0.572162 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1541  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 191 aa  43.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1789  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.484582  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2816  transcriptional regulator NfxB, putative  28.49 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7432  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21920  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.048177  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 184 aa  42.7  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0153  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 193 aa  42.4  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1988  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 181 aa  42.4  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0948482  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2422  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 230 aa  42  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.789804  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0516  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 195 aa  41.6  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1922  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 210 aa  41.2  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0515657  normal  0.344284 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3360  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 209 aa  41.2  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0120997  normal  0.690483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 227 aa  41.2  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 207 aa  41.2  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>