156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4863 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4863  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 207 aa  405  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.878301  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  50.48 
 
 		 209 aa  191  6e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2776  transcriptional regulator, TetR family  45.85 
 
 		 206 aa  168  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3350  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  37.02 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 189 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 189 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0484  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0495  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.595524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0473  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 186 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3690  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 191 aa  79.7  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.225915 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1967  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 198 aa  77  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0188577  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1889  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.2019  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 179 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  33.97 
 
 		 180 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1275  transcriptional regulator, TetR family  29.24 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0714777  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3457  transcriptional regulator, TetR family  24.57 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  hitchhiker  4.55485e-18 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2768  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5333  transcriptional regulator, TetR family  33.9 
 
 		 216 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0429  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5576  transcriptional regulator, TetR family  32.21 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  52.17 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1327  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14890  transcriptional regulator, tetR family  29.81 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0325223  normal  0.0343336 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3104  TetR family transcriptional regulator  21.82 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3783  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0045008  normal  0.0230094 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8493  transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 		 180 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 179 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2422  transcriptional regulator, TetR family  43.21 
 
 		 230 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.789804  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2000  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3660  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.880035  normal  0.502238 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 173 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2994  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 242 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0287  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 181 aa  50.1  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 195 aa  48.9  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  28.97 
 
 		 195 aa  48.9  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  28.97 
 
 		 195 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 195 aa  48.9  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  54.76 
 
 		 202 aa  48.5  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2963  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 177 aa  48.9  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 195 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3031  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 199 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3155  regulatory protein TetR  41.51 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1301  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.365782  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13066  AsnC family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 246 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3112  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8649  regulatory protein TetR  32.57 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1772  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 202 aa  46.6  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.706828  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  45.57 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 		 183 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2441  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 217 aa  45.8  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.429129  normal  0.59735 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4990  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.613992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 222 aa  45.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 188 aa  45.4  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 259 aa  45.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2594  transcriptional regulatory protein NfxB  27.89 
 
 		 184 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1664  TetR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 189 aa  45.1  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354997  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 228 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 193 aa  45.4  0.0007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3447  regulatory protein TetR  28.65 
 
 		 199 aa  45.4  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  38.83 
 
 		 219 aa  45.1  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  40.7 
 
 		 188 aa  45.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3415  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 209 aa  45.1  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5857  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 220 aa  45.1  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 204 aa  44.7  0.0009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4170  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0130344  normal  0.052898 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4980  regulatory protein TetR  34.23 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal  0.695564 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  24.2 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0875  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 289 aa  43.5  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3962  putative transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.545183  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3687  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4182  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  34.09 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>