38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1967 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1967  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 198 aa  394  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0188577  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3350  transcriptional regulator, TetR family  39.89 
 
 		 199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2776  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 206 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 		 189 aa  87.4  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 189 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3690  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.225915 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 232 aa  68.2  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4863  transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.878301  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0473  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0495  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.595524 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0484  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2422  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.789804  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3783  transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0045008  normal  0.0230094 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5333  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3112  transcriptional regulator, TetR family  36.72 
 
 		 238 aa  50.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.151742  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1327  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 198 aa  48.9  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0429  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2000  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2759  LacI family transcription regulator  34.18 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3155  regulatory protein TetR  44.23 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  27.56 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2768  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 183 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 203 aa  44.7  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0358  regulatory protein, TetR  33.9 
 
 		 240 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667156 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00232  hypothetical protein  26.59 
 
 		 192 aa  43.9  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1301  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 205 aa  42.7  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.365782  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14890  transcriptional regulator, tetR family  26.92 
 
 		 204 aa  42.4  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0325223  normal  0.0343336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5576  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 216 aa  42  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3068  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 214 aa  42  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.493248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 201 aa  41.2  0.009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0257  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 201 aa  41.2  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.837987 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04830  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  41.2  0.01  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.764774  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>