76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5998 on replicon NC_008704
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 189 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 189 aa  372  1e-102  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  49.44 
 
 		 189 aa  165  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  48.02 
 
 		 232 aa  158  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  39.2 
 
 		 209 aa  118  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3690  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 191 aa  96.3  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.225915 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1889  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 194 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.2019  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3457  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 194 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  hitchhiker  4.55485e-18 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2776  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 206 aa  85.1  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4863  transcriptional regulator, TetR family  37.09 
 
 		 207 aa  77.4  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.878301  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1967  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0188577  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2768  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 192 aa  74.7  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3104  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 185 aa  73.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 180 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1275  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0714777  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0484  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0495  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.595524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0473  TetR family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 179 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2000  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14890  transcriptional regulator, tetR family  31.03 
 
 		 204 aa  67  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0325223  normal  0.0343336 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2594  transcriptional regulatory protein NfxB  29.44 
 
 		 184 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3350  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8493  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1327  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 198 aa  58.5  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5333  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60860  transcriptional regulator NfxB  26.55 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1734  transcriptional regulator NfxB  25 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.413986 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0287  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3783  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0045008  normal  0.0230094 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2284  transcriptional regulatory protein NfxB  29.31 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000917221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7432  transcriptional regulator, TetR family  32.21 
 
 		 216 aa  53.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2430  regulatory protein LacI  26.9 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.633892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2759  LacI family transcription regulator  28.49 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 213 aa  51.6  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5241  transcriptional regulator NfxB  26.26 
 
 		 199 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 216 aa  51.2  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  26.72 
 
 		 204 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0429  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 207 aa  49.3  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3155  regulatory protein TetR  21.79 
 
 		 201 aa  48.9  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2816  transcriptional regulator NfxB, putative  27.67 
 
 		 188 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 194 aa  48.5  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1664  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 189 aa  48.5  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354997  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00232  hypothetical protein  22.54 
 
 		 192 aa  48.1  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5576  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 216 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  25.16 
 
 		 193 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 196 aa  47  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5859  transcriptional regulatory protein NfxB  26.25 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.731668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2994  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4980  regulatory protein TetR  31.29 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal  0.695564 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1301  TetR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.365782  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 187 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 183 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2776  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 213 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.556184  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4325  transcriptional regulator, TetR family  30.83 
 
 		 185 aa  45.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670247 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 188 aa  45.4  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 188 aa  45.1  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 213 aa  44.7  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2820  transcriptional regulator NfxB  24.71 
 
 		 185 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2422  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 230 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.789804  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2755  LacI family transcription regulator  23.35 
 
 		 187 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0367179  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2789  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.384058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6310  putative transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.523655  normal  0.0800729 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 218 aa  42.4  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6234  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 214 aa  42  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.662077  normal  0.711722 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 		 199 aa  42  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5857  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  42  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 173 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3493  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 196 aa  41.6  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 207 aa  41.6  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 204 aa  41.2  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>