69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4325 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4325  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 185 aa  364  1e-100  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670247 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6310  putative transcriptional regulator, TetR family  48.63 
 
 		 185 aa  154  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.523655  normal  0.0800729 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1275  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0714777  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8493  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 180 aa  80.5  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0495  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.595524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0473  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0484  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 180 aa  78.2  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2768  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 192 aa  71.2  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0287  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 181 aa  66.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2000  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3457  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  hitchhiker  4.55485e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1889  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.2019  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14890  transcriptional regulator, tetR family  32.04 
 
 		 204 aa  57  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0325223  normal  0.0343336 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3783  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0045008  normal  0.0230094 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1327  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2820  transcriptional regulator NfxB  27.45 
 
 		 185 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2816  transcriptional regulator NfxB, putative  30 
 
 		 188 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.308594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1301  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 205 aa  51.2  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.365782  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5241  transcriptional regulator NfxB  29.48 
 
 		 199 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  53.19 
 
 		 193 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 232 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2430  regulatory protein LacI  27.65 
 
 		 185 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.633892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2759  LacI family transcription regulator  29.24 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60860  transcriptional regulator NfxB  26.47 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  52 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3104  TetR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 210 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2594  transcriptional regulatory protein NfxB  30.52 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0429  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 223 aa  45.1  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2755  LacI family transcription regulator  28.57 
 
 		 187 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0367179  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3569  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 226 aa  45.1  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.467129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 202 aa  44.7  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 200 aa  44.7  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 216 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 225 aa  43.9  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2776  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0100  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 219 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5859  transcriptional regulatory protein NfxB  29.01 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.731668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3350  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3660  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.880035  normal  0.502238 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0536  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.613933  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1566  regulatory protein TetR  47.06 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0864933  normal  0.704911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5333  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 216 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 233 aa  42.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2057  putative transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 223 aa  42  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334012  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  19.35 
 
 		 196 aa  42  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  19.35 
 
 		 196 aa  42  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  19.35 
 
 		 196 aa  42  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  19.35 
 
 		 196 aa  42  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  19.35 
 
 		 196 aa  42  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  19.35 
 
 		 196 aa  41.6  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2994  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 231 aa  41.6  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 189 aa  41.6  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4203  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 216 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0570722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 213 aa  41.6  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  18.95 
 
 		 196 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5272  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 195 aa  41.2  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  31.65 
 
 		 190 aa  41.2  0.009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 187 aa  41.2  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>