115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5092 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 209 aa  418  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2776  transcriptional regulator, TetR family  52.69 
 
 		 206 aa  184  9e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.205598  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4863  transcriptional regulator, TetR family  50.48 
 
 		 207 aa  172  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.878301  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3350  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 199 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5083  putative transcriptional regulator, TetR family  38.17 
 
 		 189 aa  130  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.636855 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  40.86 
 
 		 232 aa  126  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 189 aa  118  6e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 189 aa  118  6e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3690  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 191 aa  107  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.225915 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1967  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 198 aa  105  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0188577  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1275  transcriptional regulator, TetR family  35.86 
 
 		 193 aa  82  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0714777  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8493  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 180 aa  75.9  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0484  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0495  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.595524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0473  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2768  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 192 aa  72  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 180 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3783  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 184 aa  70.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0045008  normal  0.0230094 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5333  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1889  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.2019  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3457  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.53987  hitchhiker  4.55485e-18 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0429  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1327  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 198 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2422  transcriptional regulator, TetR family  46.51 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.789804  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1301  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.365782  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  33.99 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5576  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 184 aa  56.6  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3155  regulatory protein TetR  35.9 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14890  transcriptional regulator, tetR family  31.79 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0325223  normal  0.0343336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2000  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3104  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6422  putative transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 216 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790445 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7432  transcriptional regulator, TetR family  31.95 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0767  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.504408  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 		 217 aa  49.3  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0546  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 228 aa  48.5  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.62495  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4006  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 228 aa  48.5  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3660  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 199 aa  48.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.880035  normal  0.502238 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5857  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 220 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.664827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  41.58 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2594  transcriptional regulatory protein NfxB  28.76 
 
 		 184 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4990  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.613992  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3031  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 241 aa  46.2  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  50.88 
 
 		 197 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8649  regulatory protein TetR  33.81 
 
 		 185 aa  46.2  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0210  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 259 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 242 aa  46.2  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2786  regulatory protein TetR  42.17 
 
 		 243 aa  46.2  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 197 aa  45.8  0.0005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04693  transcriptional regulator TetR/acrR family  42.7 
 
 		 232 aa  45.8  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7119  putative transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00221905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0927  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 215 aa  45.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.468026  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6310  putative transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 185 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.523655  normal  0.0800729 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2759  LacI family transcription regulator  42.86 
 
 		 198 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4325  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 185 aa  45.1  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.670247 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60860  transcriptional regulator NfxB  35.44 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00232  hypothetical protein  27.08 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1734  transcriptional regulator NfxB  29.57 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.413986 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0875  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 209 aa  44.3  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6201  transcriptional regulator, TetR family  49.25 
 
 		 189 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0829103  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 179 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 192 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3415  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.52107  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 193 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1897  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4980  regulatory protein TetR  29.03 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.432657  normal  0.695564 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1362  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  40.68 
 
 		 182 aa  43.1  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 222 aa  42.4  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3950  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.390353  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4739  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  42.4  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 184 aa  42.4  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 243 aa  42.4  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  36.28 
 
 		 214 aa  42.4  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 193 aa  42.4  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8897  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 222 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2284  transcriptional regulatory protein NfxB  32.14 
 
 		 196 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000917221 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 218 aa  42  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 184 aa  42  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>