110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8649 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8649  regulatory protein TetR  100 
 
 		 185 aa  358  3e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1327  transcriptional regulator, TetR family  33.7 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.188368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5333  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 216 aa  72  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2000  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 201 aa  72  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.669557 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0429  transcriptional regulator, TetR family  36.55 
 
 		 207 aa  65.1  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0208  transcriptional regulator, TetR family  37.41 
 
 		 193 aa  64.7  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.168668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0755  putative transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1275  transcriptional regulator, TetR family  30.47 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0714777  normal  0.0115307 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2422  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 230 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.789804  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5092  transcriptional regulator, TetR family  33.81 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.193405 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 		 184 aa  55.1  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4064  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.528803  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  31.16 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8493  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 180 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.996543 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 195 aa  52  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2446  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 229 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.8444  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1788  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8897  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 222 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14890  transcriptional regulator, tetR family  31.16 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0325223  normal  0.0343336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 173 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0240  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 180 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 186 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4085  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 232 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 199 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 217 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  30 
 
 		 223 aa  47.8  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0484  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 186 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0495  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 186 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.595524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0473  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 186 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  32.9 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5576  transcriptional regulator, TetR family  30.97 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7119  putative transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00221905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4904  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 225 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5597  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 189 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 222 aa  45.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5998  TetR family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 189 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000044097 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 227 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2994  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 231 aa  45.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  26.61 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3293  regulatory protein TetR  44.29 
 
 		 208 aa  45.4  0.0004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147599  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 219 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  45.4  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0665  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 179 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.950622  normal  0.396489 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 211 aa  45.1  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  42.03 
 
 		 231 aa  45.1  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 195 aa  45.1  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 194 aa  44.7  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  40.82 
 
 		 199 aa  45.1  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2768  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 192 aa  44.7  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0611  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 203 aa  44.7  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2057  putative transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 		 223 aa  44.7  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334012  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 184 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6310  putative transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 185 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.523655  normal  0.0800729 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0331  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  27.78 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 198 aa  43.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 219 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1510  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 240 aa  43.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116924  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4086  putative transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 237 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3502  nucleoid occlusion protein  25.55 
 
 		 195 aa  42.4  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.284468  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1774  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 231 aa  42.7  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277997  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2557  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 186 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5792  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 216 aa  42.7  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 232 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7432  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 216 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2347  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 223 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123383  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2131  regulatory protein, TetR  26.98 
 
 		 218 aa  42.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00771887  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3010  TetR family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 218 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0551  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 213 aa  42.4  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 199 aa  42  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 230 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_004310  BR1403  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 241 aa  42  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3905  TetR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 211 aa  42  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1360  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 270 aa  42  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2459  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 198 aa  42  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.285748  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 183 aa  42  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4863  transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 		 207 aa  42  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.878301  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 176 aa  42  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  28.74 
 
 		 206 aa  42  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 245 aa  41.6  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2371  transcriptional regulator, TetR family  30.66 
 
 		 219 aa  42  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0164383  normal  0.061065 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 194 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 194 aa  41.6  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  37.31 
 
 		 174 aa  41.6  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 217 aa  41.6  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>